Protein–RNA interactions for Protein: P02549

SPTA1, Spectrin alpha chain, erythrocytic 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTA1P02549 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SPTA1P02549 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SPTA1P02549 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SPTA1P02549 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
SPTA1P02549 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SPTA1P02549 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SPTA1P02549 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SPTA1P02549 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SPTA1P02549 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SPTA1P02549 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SPTA1P02549 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SPTA1P02549 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SPTA1P02549 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SPTA1P02549 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SPTA1P02549 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SPTA1P02549 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SPTA1P02549 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SPTA1P02549 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SPTA1P02549 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SPTA1P02549 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SPTA1P02549 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SPTA1P02549 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
SPTA1P02549 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SPTA1P02549 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SPTA1P02549 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SPTA1P02549 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
SPTA1P02549 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SPTA1P02549 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SPTA1P02549 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SPTA1P02549 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SPTA1P02549 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SPTA1P02549 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SPTA1P02549 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SPTA1P02549 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SPTA1P02549 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
SPTA1P02549 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SPTA1P02549 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SPTA1P02549 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SPTA1P02549 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SPTA1P02549 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SPTA1P02549 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SPTA1P02549 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SPTA1P02549 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SPTA1P02549 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SPTA1P02549 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SPTA1P02549 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SPTA1P02549 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SPTA1P02549 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SPTA1P02549 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SPTA1P02549 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SPTA1P02549 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
SPTA1P02549 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SPTA1P02549 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SPTA1P02549 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SPTA1P02549 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SPTA1P02549 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SPTA1P02549 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SPTA1P02549 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SPTA1P02549 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
SPTA1P02549 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SPTA1P02549 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SPTA1P02549 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SPTA1P02549 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SPTA1P02549 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SPTA1P02549 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SPTA1P02549 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SPTA1P02549 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SPTA1P02549 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SPTA1P02549 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SPTA1P02549 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SPTA1P02549 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SPTA1P02549 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SPTA1P02549 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SPTA1P02549 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SPTA1P02549 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
SPTA1P02549 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SPTA1P02549 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SPTA1P02549 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
SPTA1P02549 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SPTA1P02549 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SPTA1P02549 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SPTA1P02549 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SPTA1P02549 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SPTA1P02549 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SPTA1P02549 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SPTA1P02549 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SPTA1P02549 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SPTA1P02549 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SPTA1P02549 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SPTA1P02549 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SPTA1P02549 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SPTA1P02549 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SPTA1P02549 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SPTA1P02549 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SPTA1P02549 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SPTA1P02549 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SPTA1P02549 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SPTA1P02549 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SPTA1P02549 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SPTA1P02549 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.2 ms