Protein–RNA interactions for Protein: P01906

HLA-DQA2, HLA class II histocompatibility antigen, DQ alpha 2 chain, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DQA2P01906 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HLA-DQA2P01906 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HLA-DQA2P01906 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HLA-DQA2P01906 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HLA-DQA2P01906 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HLA-DQA2P01906 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HLA-DQA2P01906 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
HLA-DQA2P01906 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HLA-DQA2P01906 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HLA-DQA2P01906 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HLA-DQA2P01906 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HLA-DQA2P01906 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HLA-DQA2P01906 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HLA-DQA2P01906 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HLA-DQA2P01906 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HLA-DQA2P01906 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HLA-DQA2P01906 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HLA-DQA2P01906 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HLA-DQA2P01906 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HLA-DQA2P01906 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HLA-DQA2P01906 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HLA-DQA2P01906 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HLA-DQA2P01906 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HLA-DQA2P01906 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
HLA-DQA2P01906 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HLA-DQA2P01906 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HLA-DQA2P01906 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HLA-DQA2P01906 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HLA-DQA2P01906 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HLA-DQA2P01906 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HLA-DQA2P01906 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HLA-DQA2P01906 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HLA-DQA2P01906 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HLA-DQA2P01906 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HLA-DQA2P01906 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HLA-DQA2P01906 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HLA-DQA2P01906 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HLA-DQA2P01906 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HLA-DQA2P01906 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HLA-DQA2P01906 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HLA-DQA2P01906 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HLA-DQA2P01906 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HLA-DQA2P01906 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HLA-DQA2P01906 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
HLA-DQA2P01906 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HLA-DQA2P01906 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HLA-DQA2P01906 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HLA-DQA2P01906 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HLA-DQA2P01906 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HLA-DQA2P01906 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
HLA-DQA2P01906 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HLA-DQA2P01906 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
HLA-DQA2P01906 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HLA-DQA2P01906 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HLA-DQA2P01906 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HLA-DQA2P01906 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HLA-DQA2P01906 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HLA-DQA2P01906 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HLA-DQA2P01906 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HLA-DQA2P01906 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HLA-DQA2P01906 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HLA-DQA2P01906 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HLA-DQA2P01906 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HLA-DQA2P01906 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HLA-DQA2P01906 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HLA-DQA2P01906 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HLA-DQA2P01906 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HLA-DQA2P01906 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HLA-DQA2P01906 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HLA-DQA2P01906 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HLA-DQA2P01906 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
HLA-DQA2P01906 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HLA-DQA2P01906 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HLA-DQA2P01906 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HLA-DQA2P01906 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
HLA-DQA2P01906 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HLA-DQA2P01906 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HLA-DQA2P01906 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HLA-DQA2P01906 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HLA-DQA2P01906 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HLA-DQA2P01906 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HLA-DQA2P01906 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HLA-DQA2P01906 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HLA-DQA2P01906 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HLA-DQA2P01906 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
HLA-DQA2P01906 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HLA-DQA2P01906 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HLA-DQA2P01906 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HLA-DQA2P01906 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HLA-DQA2P01906 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HLA-DQA2P01906 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HLA-DQA2P01906 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HLA-DQA2P01906 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HLA-DQA2P01906 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HLA-DQA2P01906 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HLA-DQA2P01906 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HLA-DQA2P01906 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HLA-DQA2P01906 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HLA-DQA2P01906 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HLA-DQA2P01906 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms