Protein–RNA interactions for Protein: P01011

SERPINA3, Alpha-1-antichymotrypsin, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERPINA3P01011 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SERPINA3P01011 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SERPINA3P01011 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SERPINA3P01011 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SERPINA3P01011 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SERPINA3P01011 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SERPINA3P01011 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SERPINA3P01011 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SERPINA3P01011 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SERPINA3P01011 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SERPINA3P01011 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SERPINA3P01011 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SERPINA3P01011 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SERPINA3P01011 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SERPINA3P01011 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SERPINA3P01011 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SERPINA3P01011 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SERPINA3P01011 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SERPINA3P01011 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SERPINA3P01011 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SERPINA3P01011 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SERPINA3P01011 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SERPINA3P01011 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SERPINA3P01011 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
SERPINA3P01011 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SERPINA3P01011 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SERPINA3P01011 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SERPINA3P01011 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SERPINA3P01011 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SERPINA3P01011 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SERPINA3P01011 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SERPINA3P01011 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SERPINA3P01011 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SERPINA3P01011 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
SERPINA3P01011 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.28
SERPINA3P01011 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SERPINA3P01011 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SERPINA3P01011 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SERPINA3P01011 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SERPINA3P01011 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SERPINA3P01011 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SERPINA3P01011 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SERPINA3P01011 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SERPINA3P01011 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SERPINA3P01011 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SERPINA3P01011 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SERPINA3P01011 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SERPINA3P01011 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SERPINA3P01011 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SERPINA3P01011 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SERPINA3P01011 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SERPINA3P01011 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SERPINA3P01011 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SERPINA3P01011 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SERPINA3P01011 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SERPINA3P01011 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SERPINA3P01011 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SERPINA3P01011 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SERPINA3P01011 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SERPINA3P01011 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SERPINA3P01011 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SERPINA3P01011 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SERPINA3P01011 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SERPINA3P01011 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SERPINA3P01011 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SERPINA3P01011 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SERPINA3P01011 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SERPINA3P01011 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SERPINA3P01011 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SERPINA3P01011 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SERPINA3P01011 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SERPINA3P01011 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SERPINA3P01011 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SERPINA3P01011 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SERPINA3P01011 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SERPINA3P01011 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SERPINA3P01011 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SERPINA3P01011 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SERPINA3P01011 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SERPINA3P01011 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SERPINA3P01011 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SERPINA3P01011 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SERPINA3P01011 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SERPINA3P01011 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SERPINA3P01011 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
SERPINA3P01011 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SERPINA3P01011 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SERPINA3P01011 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SERPINA3P01011 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SERPINA3P01011 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SERPINA3P01011 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SERPINA3P01011 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SERPINA3P01011 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SERPINA3P01011 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SERPINA3P01011 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SERPINA3P01011 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SERPINA3P01011 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SERPINA3P01011 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SERPINA3P01011 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SERPINA3P01011 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.3 ms