Protein–RNA interactions for Protein: P00966

ASS1, Argininosuccinate synthase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASS1P00966 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
ASS1P00966 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
ASS1P00966 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.12
ASS1P00966 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ASS1P00966 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ASS1P00966 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ASS1P00966 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ASS1P00966 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
ASS1P00966 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ASS1P00966 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
ASS1P00966 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
ASS1P00966 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
ASS1P00966 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
ASS1P00966 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
ASS1P00966 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
ASS1P00966 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ASS1P00966 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ASS1P00966 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
ASS1P00966 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
ASS1P00966 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
ASS1P00966 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
ASS1P00966 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ASS1P00966 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
ASS1P00966 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
ASS1P00966 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
ASS1P00966 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
ASS1P00966 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
ASS1P00966 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
ASS1P00966 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
ASS1P00966 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
ASS1P00966 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
ASS1P00966 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ASS1P00966 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ASS1P00966 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ASS1P00966 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
ASS1P00966 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ASS1P00966 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
ASS1P00966 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
ASS1P00966 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
ASS1P00966 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
ASS1P00966 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
ASS1P00966 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
ASS1P00966 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
ASS1P00966 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
ASS1P00966 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
ASS1P00966 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
ASS1P00966 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
ASS1P00966 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
ASS1P00966 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
ASS1P00966 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
ASS1P00966 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
ASS1P00966 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ASS1P00966 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ASS1P00966 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ASS1P00966 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
ASS1P00966 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ASS1P00966 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ASS1P00966 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
ASS1P00966 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ASS1P00966 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ASS1P00966 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ASS1P00966 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ASS1P00966 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ASS1P00966 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ASS1P00966 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ASS1P00966 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ASS1P00966 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ASS1P00966 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
ASS1P00966 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
ASS1P00966 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
ASS1P00966 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ASS1P00966 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ASS1P00966 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ASS1P00966 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ASS1P00966 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC28.05■■■□□ 2.08
ASS1P00966 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
ASS1P00966 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ASS1P00966 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ASS1P00966 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ASS1P00966 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
ASS1P00966 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
ASS1P00966 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
ASS1P00966 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
ASS1P00966 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ASS1P00966 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ASS1P00966 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ASS1P00966 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ASS1P00966 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ASS1P00966 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
ASS1P00966 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ASS1P00966 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
ASS1P00966 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ASS1P00966 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
ASS1P00966 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ASS1P00966 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
ASS1P00966 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
ASS1P00966 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
ASS1P00966 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ASS1P00966 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ASS1P00966 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms