Protein–RNA interactions for Protein: O95857

TSPAN13, Tetraspanin-13, humanhuman

Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN13O95857 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TSPAN13O95857 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TSPAN13O95857 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TSPAN13O95857 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TSPAN13O95857 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TSPAN13O95857 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TSPAN13O95857 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TSPAN13O95857 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TSPAN13O95857 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TSPAN13O95857 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TSPAN13O95857 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TSPAN13O95857 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TSPAN13O95857 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TSPAN13O95857 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TSPAN13O95857 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TSPAN13O95857 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TSPAN13O95857 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TSPAN13O95857 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TSPAN13O95857 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TSPAN13O95857 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TSPAN13O95857 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TSPAN13O95857 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TSPAN13O95857 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TSPAN13O95857 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TSPAN13O95857 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TSPAN13O95857 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TSPAN13O95857 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TSPAN13O95857 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TSPAN13O95857 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TSPAN13O95857 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TSPAN13O95857 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TSPAN13O95857 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TSPAN13O95857 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TSPAN13O95857 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TSPAN13O95857 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TSPAN13O95857 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TSPAN13O95857 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TSPAN13O95857 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TSPAN13O95857 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
TSPAN13O95857 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TSPAN13O95857 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TSPAN13O95857 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TSPAN13O95857 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TSPAN13O95857 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TSPAN13O95857 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TSPAN13O95857 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TSPAN13O95857 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TSPAN13O95857 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TSPAN13O95857 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TSPAN13O95857 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TSPAN13O95857 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TSPAN13O95857 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TSPAN13O95857 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TSPAN13O95857 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TSPAN13O95857 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TSPAN13O95857 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TSPAN13O95857 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TSPAN13O95857 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TSPAN13O95857 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TSPAN13O95857 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TSPAN13O95857 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TSPAN13O95857 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
TSPAN13O95857 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TSPAN13O95857 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TSPAN13O95857 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TSPAN13O95857 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TSPAN13O95857 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TSPAN13O95857 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TSPAN13O95857 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TSPAN13O95857 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TSPAN13O95857 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TSPAN13O95857 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TSPAN13O95857 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TSPAN13O95857 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TSPAN13O95857 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TSPAN13O95857 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TSPAN13O95857 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TSPAN13O95857 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TSPAN13O95857 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TSPAN13O95857 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TSPAN13O95857 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TSPAN13O95857 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TSPAN13O95857 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TSPAN13O95857 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TSPAN13O95857 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TSPAN13O95857 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TSPAN13O95857 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TSPAN13O95857 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TSPAN13O95857 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TSPAN13O95857 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TSPAN13O95857 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TSPAN13O95857 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TSPAN13O95857 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TSPAN13O95857 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TSPAN13O95857 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TSPAN13O95857 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TSPAN13O95857 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TSPAN13O95857 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TSPAN13O95857 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TSPAN13O95857 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms