Protein–RNA interactions for Protein: O95810

CAVIN2, Caveolae-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAVIN2O95810 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
CAVIN2O95810 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
CAVIN2O95810 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CAVIN2O95810 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CAVIN2O95810 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CAVIN2O95810 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
CAVIN2O95810 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
CAVIN2O95810 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
CAVIN2O95810 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
CAVIN2O95810 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CAVIN2O95810 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CAVIN2O95810 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CAVIN2O95810 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CAVIN2O95810 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
CAVIN2O95810 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CAVIN2O95810 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CAVIN2O95810 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
CAVIN2O95810 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
CAVIN2O95810 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
CAVIN2O95810 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
CAVIN2O95810 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
CAVIN2O95810 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CAVIN2O95810 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CAVIN2O95810 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CAVIN2O95810 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
CAVIN2O95810 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CAVIN2O95810 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
CAVIN2O95810 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CAVIN2O95810 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
CAVIN2O95810 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CAVIN2O95810 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CAVIN2O95810 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
CAVIN2O95810 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CAVIN2O95810 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
CAVIN2O95810 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
CAVIN2O95810 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
CAVIN2O95810 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
CAVIN2O95810 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CAVIN2O95810 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CAVIN2O95810 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CAVIN2O95810 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
CAVIN2O95810 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CAVIN2O95810 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CAVIN2O95810 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
CAVIN2O95810 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CAVIN2O95810 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
CAVIN2O95810 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
CAVIN2O95810 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
CAVIN2O95810 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CAVIN2O95810 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
CAVIN2O95810 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CAVIN2O95810 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
CAVIN2O95810 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
CAVIN2O95810 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CAVIN2O95810 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
CAVIN2O95810 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
CAVIN2O95810 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CAVIN2O95810 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
CAVIN2O95810 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CAVIN2O95810 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CAVIN2O95810 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
CAVIN2O95810 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
CAVIN2O95810 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CAVIN2O95810 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CAVIN2O95810 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
CAVIN2O95810 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CAVIN2O95810 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
CAVIN2O95810 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CAVIN2O95810 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CAVIN2O95810 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CAVIN2O95810 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
CAVIN2O95810 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
CAVIN2O95810 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
CAVIN2O95810 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
CAVIN2O95810 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
CAVIN2O95810 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CAVIN2O95810 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
CAVIN2O95810 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
CAVIN2O95810 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
CAVIN2O95810 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
CAVIN2O95810 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CAVIN2O95810 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CAVIN2O95810 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CAVIN2O95810 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CAVIN2O95810 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CAVIN2O95810 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CAVIN2O95810 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
CAVIN2O95810 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CAVIN2O95810 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
CAVIN2O95810 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
CAVIN2O95810 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC29.14■■■□□ 2.25
CAVIN2O95810 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CAVIN2O95810 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
CAVIN2O95810 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
CAVIN2O95810 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
CAVIN2O95810 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CAVIN2O95810 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CAVIN2O95810 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CAVIN2O95810 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CAVIN2O95810 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms