Protein–RNA interactions for Protein: O94964

SOGA1, Protein SOGA1, humanhuman

Predictions only

Length 1,423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOGA1O94964 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC45.26■■■■■ 4.84
SOGA1O94964 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC45.26■■■■■ 4.84
SOGA1O94964 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC45.26■■■■■ 4.84
SOGA1O94964 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC45.26■■■■■ 4.84
SOGA1O94964 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC45.26■■■■■ 4.84
SOGA1O94964 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC45.26■■■■■ 4.84
SOGA1O94964 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC45.26■■■■■ 4.84
SOGA1O94964 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC45.26■■■■■ 4.84
SOGA1O94964 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC45.26■■■■■ 4.84
SOGA1O94964 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC45.26■■■■■ 4.84
SOGA1O94964 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC45.26■■■■■ 4.84
SOGA1O94964 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC45.26■■■■■ 4.84
SOGA1O94964 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.25■■■■■ 4.83
SOGA1O94964 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC45.24■■■■■ 4.83
SOGA1O94964 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC45.24■■■■■ 4.83
SOGA1O94964 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.23■■■■■ 4.83
SOGA1O94964 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC45.23■■■■■ 4.83
SOGA1O94964 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC45.2■■■■■ 4.83
SOGA1O94964 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.19■■■■■ 4.82
SOGA1O94964 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.18■■■■■ 4.82
SOGA1O94964 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.17■■■■■ 4.82
SOGA1O94964 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC45.17■■■■■ 4.82
SOGA1O94964 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC45.16■■■■■ 4.82
SOGA1O94964 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC45.14■■■■■ 4.82
SOGA1O94964 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC45.14■■■■■ 4.82
SOGA1O94964 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC45.12■■■■■ 4.81
SOGA1O94964 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC45.12■■■■■ 4.81
SOGA1O94964 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC45.1■■■■■ 4.81
SOGA1O94964 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC45.09■■■■■ 4.81
SOGA1O94964 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC45.09■■■■■ 4.81
SOGA1O94964 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45.08■■■■■ 4.81
SOGA1O94964 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC45.08■■■■■ 4.81
SOGA1O94964 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC45.07■■■■■ 4.81
SOGA1O94964 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.06■■■■■ 4.8
SOGA1O94964 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC45.02■■■■■ 4.8
SOGA1O94964 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC45.02■■■■■ 4.8
SOGA1O94964 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC45.01■■■■■ 4.8
SOGA1O94964 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.01■■■■■ 4.8
SOGA1O94964 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC45.01■■■■■ 4.8
SOGA1O94964 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC45.01■■■■■ 4.8
SOGA1O94964 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC45■■■■■ 4.79
SOGA1O94964 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.99■■■■■ 4.79
SOGA1O94964 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.99■■■■■ 4.79
SOGA1O94964 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC44.97■■■■■ 4.79
SOGA1O94964 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC44.97■■■■■ 4.79
SOGA1O94964 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC44.97■■■■■ 4.79
SOGA1O94964 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC44.97■■■■■ 4.79
SOGA1O94964 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.96■■■■■ 4.79
SOGA1O94964 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC44.96■■■■■ 4.79
SOGA1O94964 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC44.95■■■■■ 4.79
SOGA1O94964 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC44.95■■■■■ 4.79
SOGA1O94964 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC44.94■■■■■ 4.79
SOGA1O94964 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC44.94■■■■■ 4.79
SOGA1O94964 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC44.94■■■■■ 4.79
SOGA1O94964 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC44.94■■■■■ 4.79
SOGA1O94964 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC44.94■■■■■ 4.79
SOGA1O94964 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC44.94■■■■■ 4.79
SOGA1O94964 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.94■■■■■ 4.79
SOGA1O94964 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.94■■■■■ 4.79
SOGA1O94964 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.94■■■■■ 4.79
SOGA1O94964 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC44.92■■■■■ 4.78
SOGA1O94964 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC44.91■■■■■ 4.78
SOGA1O94964 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC44.89■■■■■ 4.78
SOGA1O94964 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC44.89■■■■■ 4.78
SOGA1O94964 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC44.89■■■■■ 4.78
SOGA1O94964 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.88■■■■■ 4.78
SOGA1O94964 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC44.88■■■■■ 4.77
SOGA1O94964 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC44.84■■■■■ 4.77
SOGA1O94964 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.81■■■■■ 4.76
SOGA1O94964 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC44.81■■■■■ 4.76
SOGA1O94964 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC44.81■■■■■ 4.76
SOGA1O94964 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC44.8■■■■■ 4.76
SOGA1O94964 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC44.8■■■■■ 4.76
SOGA1O94964 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC44.79■■■■■ 4.76
SOGA1O94964 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC44.79■■■■■ 4.76
SOGA1O94964 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC44.78■■■■■ 4.76
SOGA1O94964 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.78■■■■■ 4.76
SOGA1O94964 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC44.78■■■■■ 4.76
SOGA1O94964 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC44.77■■■■■ 4.76
SOGA1O94964 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC44.76■■■■■ 4.76
SOGA1O94964 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.75■■■■■ 4.75
SOGA1O94964 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.75■■■■■ 4.75
SOGA1O94964 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC44.74■■■■■ 4.75
SOGA1O94964 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC44.74■■■■■ 4.75
SOGA1O94964 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.72■■■■■ 4.75
SOGA1O94964 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC44.71■■■■■ 4.75
SOGA1O94964 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC44.71■■■■■ 4.75
SOGA1O94964 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC44.7■■■■■ 4.75
SOGA1O94964 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.7■■■■■ 4.75
SOGA1O94964 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC44.7■■■■■ 4.75
SOGA1O94964 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC44.69■■■■■ 4.75
SOGA1O94964 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.69■■■■■ 4.74
SOGA1O94964 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC44.68■■■■■ 4.74
SOGA1O94964 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC44.68■■■■■ 4.74
SOGA1O94964 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC44.67■■■■■ 4.74
SOGA1O94964 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC44.67■■■■■ 4.74
SOGA1O94964 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC44.67■■■■■ 4.74
SOGA1O94964 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC44.66■■■■■ 4.74
SOGA1O94964 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.66■■■■■ 4.74
SOGA1O94964 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC44.65■■■■■ 4.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.8 ms