Protein–RNA interactions for Protein: O94855

SEC24D, Protein transport protein Sec24D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC24DO94855 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SEC24DO94855 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SEC24DO94855 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SEC24DO94855 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SEC24DO94855 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SEC24DO94855 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
SEC24DO94855 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SEC24DO94855 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
SEC24DO94855 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SEC24DO94855 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SEC24DO94855 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SEC24DO94855 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SEC24DO94855 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SEC24DO94855 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SEC24DO94855 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SEC24DO94855 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SEC24DO94855 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SEC24DO94855 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SEC24DO94855 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SEC24DO94855 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SEC24DO94855 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SEC24DO94855 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SEC24DO94855 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SEC24DO94855 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SEC24DO94855 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SEC24DO94855 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SEC24DO94855 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SEC24DO94855 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SEC24DO94855 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SEC24DO94855 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SEC24DO94855 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SEC24DO94855 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SEC24DO94855 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SEC24DO94855 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
SEC24DO94855 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SEC24DO94855 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SEC24DO94855 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SEC24DO94855 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SEC24DO94855 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SEC24DO94855 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SEC24DO94855 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SEC24DO94855 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SEC24DO94855 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SEC24DO94855 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SEC24DO94855 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SEC24DO94855 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SEC24DO94855 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SEC24DO94855 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SEC24DO94855 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SEC24DO94855 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SEC24DO94855 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SEC24DO94855 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SEC24DO94855 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SEC24DO94855 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SEC24DO94855 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SEC24DO94855 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SEC24DO94855 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SEC24DO94855 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SEC24DO94855 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SEC24DO94855 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
SEC24DO94855 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SEC24DO94855 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SEC24DO94855 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SEC24DO94855 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SEC24DO94855 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SEC24DO94855 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SEC24DO94855 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SEC24DO94855 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SEC24DO94855 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SEC24DO94855 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SEC24DO94855 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SEC24DO94855 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SEC24DO94855 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SEC24DO94855 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SEC24DO94855 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SEC24DO94855 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SEC24DO94855 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SEC24DO94855 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SEC24DO94855 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
SEC24DO94855 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SEC24DO94855 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SEC24DO94855 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SEC24DO94855 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SEC24DO94855 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SEC24DO94855 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SEC24DO94855 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SEC24DO94855 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SEC24DO94855 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SEC24DO94855 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SEC24DO94855 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SEC24DO94855 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SEC24DO94855 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SEC24DO94855 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SEC24DO94855 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SEC24DO94855 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SEC24DO94855 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SEC24DO94855 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SEC24DO94855 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SEC24DO94855 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SEC24DO94855 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10 ms