Protein–RNA interactions for Protein: O75508

CLDN11, Claudin-11, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN11O75508 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CLDN11O75508 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CLDN11O75508 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CLDN11O75508 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
CLDN11O75508 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CLDN11O75508 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CLDN11O75508 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CLDN11O75508 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CLDN11O75508 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CLDN11O75508 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CLDN11O75508 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CLDN11O75508 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CLDN11O75508 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CLDN11O75508 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CLDN11O75508 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CLDN11O75508 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CLDN11O75508 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CLDN11O75508 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
CLDN11O75508 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
CLDN11O75508 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
CLDN11O75508 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CLDN11O75508 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CLDN11O75508 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CLDN11O75508 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CLDN11O75508 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
CLDN11O75508 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CLDN11O75508 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CLDN11O75508 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CLDN11O75508 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
CLDN11O75508 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CLDN11O75508 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CLDN11O75508 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CLDN11O75508 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CLDN11O75508 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CLDN11O75508 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CLDN11O75508 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CLDN11O75508 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CLDN11O75508 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
CLDN11O75508 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CLDN11O75508 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CLDN11O75508 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CLDN11O75508 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
CLDN11O75508 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CLDN11O75508 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CLDN11O75508 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
CLDN11O75508 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CLDN11O75508 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CLDN11O75508 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CLDN11O75508 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CLDN11O75508 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CLDN11O75508 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CLDN11O75508 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
CLDN11O75508 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CLDN11O75508 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CLDN11O75508 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CLDN11O75508 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CLDN11O75508 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CLDN11O75508 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CLDN11O75508 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CLDN11O75508 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CLDN11O75508 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CLDN11O75508 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CLDN11O75508 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CLDN11O75508 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CLDN11O75508 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CLDN11O75508 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CLDN11O75508 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CLDN11O75508 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.88
CLDN11O75508 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CLDN11O75508 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CLDN11O75508 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CLDN11O75508 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CLDN11O75508 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
CLDN11O75508 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CLDN11O75508 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CLDN11O75508 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CLDN11O75508 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CLDN11O75508 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CLDN11O75508 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CLDN11O75508 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CLDN11O75508 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CLDN11O75508 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CLDN11O75508 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CLDN11O75508 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CLDN11O75508 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CLDN11O75508 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CLDN11O75508 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CLDN11O75508 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CLDN11O75508 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CLDN11O75508 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CLDN11O75508 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CLDN11O75508 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CLDN11O75508 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
CLDN11O75508 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CLDN11O75508 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CLDN11O75508 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CLDN11O75508 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CLDN11O75508 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CLDN11O75508 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CLDN11O75508 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms