Protein–RNA interactions for Protein: O60506

SYNCRIP, Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein Q, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNCRIPO60506 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SYNCRIPO60506 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SYNCRIPO60506 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SYNCRIPO60506 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SYNCRIPO60506 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SYNCRIPO60506 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SYNCRIPO60506 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SYNCRIPO60506 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SYNCRIPO60506 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SYNCRIPO60506 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SYNCRIPO60506 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SYNCRIPO60506 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SYNCRIPO60506 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SYNCRIPO60506 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SYNCRIPO60506 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SYNCRIPO60506 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SYNCRIPO60506 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SYNCRIPO60506 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SYNCRIPO60506 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SYNCRIPO60506 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SYNCRIPO60506 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SYNCRIPO60506 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SYNCRIPO60506 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SYNCRIPO60506 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SYNCRIPO60506 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SYNCRIPO60506 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SYNCRIPO60506 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SYNCRIPO60506 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SYNCRIPO60506 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SYNCRIPO60506 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SYNCRIPO60506 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SYNCRIPO60506 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
SYNCRIPO60506 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SYNCRIPO60506 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SYNCRIPO60506 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SYNCRIPO60506 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SYNCRIPO60506 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SYNCRIPO60506 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SYNCRIPO60506 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SYNCRIPO60506 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SYNCRIPO60506 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
SYNCRIPO60506 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SYNCRIPO60506 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SYNCRIPO60506 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SYNCRIPO60506 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SYNCRIPO60506 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
SYNCRIPO60506 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
SYNCRIPO60506 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
SYNCRIPO60506 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SYNCRIPO60506 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SYNCRIPO60506 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SYNCRIPO60506 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SYNCRIPO60506 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SYNCRIPO60506 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SYNCRIPO60506 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SYNCRIPO60506 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SYNCRIPO60506 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
SYNCRIPO60506 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SYNCRIPO60506 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SYNCRIPO60506 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SYNCRIPO60506 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
SYNCRIPO60506 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
SYNCRIPO60506 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SYNCRIPO60506 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SYNCRIPO60506 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SYNCRIPO60506 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SYNCRIPO60506 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SYNCRIPO60506 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
SYNCRIPO60506 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SYNCRIPO60506 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SYNCRIPO60506 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SYNCRIPO60506 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SYNCRIPO60506 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SYNCRIPO60506 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SYNCRIPO60506 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SYNCRIPO60506 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SYNCRIPO60506 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SYNCRIPO60506 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
SYNCRIPO60506 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SYNCRIPO60506 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SYNCRIPO60506 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SYNCRIPO60506 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.64■■□□□ 1.86
SYNCRIPO60506 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SYNCRIPO60506 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
SYNCRIPO60506 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SYNCRIPO60506 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SYNCRIPO60506 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SYNCRIPO60506 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SYNCRIPO60506 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SYNCRIPO60506 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SYNCRIPO60506 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SYNCRIPO60506 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SYNCRIPO60506 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SYNCRIPO60506 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SYNCRIPO60506 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SYNCRIPO60506 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SYNCRIPO60506 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SYNCRIPO60506 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SYNCRIPO60506 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SYNCRIPO60506 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms