Protein–RNA interactions for Protein: O43716

GATC, Glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit C, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATCO43716 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GATCO43716 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GATCO43716 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GATCO43716 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GATCO43716 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GATCO43716 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GATCO43716 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GATCO43716 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GATCO43716 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GATCO43716 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
GATCO43716 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
GATCO43716 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
GATCO43716 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GATCO43716 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GATCO43716 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GATCO43716 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GATCO43716 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GATCO43716 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GATCO43716 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GATCO43716 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GATCO43716 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GATCO43716 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GATCO43716 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GATCO43716 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GATCO43716 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GATCO43716 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GATCO43716 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GATCO43716 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
GATCO43716 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GATCO43716 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GATCO43716 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GATCO43716 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GATCO43716 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GATCO43716 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GATCO43716 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GATCO43716 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GATCO43716 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GATCO43716 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GATCO43716 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GATCO43716 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GATCO43716 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
GATCO43716 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GATCO43716 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GATCO43716 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GATCO43716 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GATCO43716 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GATCO43716 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GATCO43716 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
GATCO43716 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
GATCO43716 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
GATCO43716 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
GATCO43716 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
GATCO43716 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
GATCO43716 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GATCO43716 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GATCO43716 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GATCO43716 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GATCO43716 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GATCO43716 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
GATCO43716 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GATCO43716 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
GATCO43716 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GATCO43716 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GATCO43716 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GATCO43716 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GATCO43716 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GATCO43716 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GATCO43716 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GATCO43716 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GATCO43716 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GATCO43716 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GATCO43716 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GATCO43716 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GATCO43716 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GATCO43716 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GATCO43716 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GATCO43716 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GATCO43716 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GATCO43716 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GATCO43716 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GATCO43716 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GATCO43716 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GATCO43716 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GATCO43716 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
GATCO43716 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GATCO43716 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GATCO43716 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GATCO43716 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GATCO43716 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GATCO43716 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GATCO43716 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GATCO43716 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GATCO43716 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GATCO43716 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GATCO43716 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GATCO43716 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GATCO43716 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GATCO43716 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GATCO43716 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GATCO43716 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 115.8 ms