Protein–RNA interactions for Protein: O43508

TNFSF12, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 12, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF12O43508 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TNFSF12O43508 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TNFSF12O43508 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TNFSF12O43508 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TNFSF12O43508 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TNFSF12O43508 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TNFSF12O43508 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TNFSF12O43508 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TNFSF12O43508 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TNFSF12O43508 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TNFSF12O43508 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TNFSF12O43508 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
TNFSF12O43508 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TNFSF12O43508 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TNFSF12O43508 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TNFSF12O43508 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TNFSF12O43508 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TNFSF12O43508 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TNFSF12O43508 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TNFSF12O43508 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TNFSF12O43508 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TNFSF12O43508 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TNFSF12O43508 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TNFSF12O43508 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TNFSF12O43508 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TNFSF12O43508 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TNFSF12O43508 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TNFSF12O43508 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TNFSF12O43508 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TNFSF12O43508 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TNFSF12O43508 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TNFSF12O43508 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TNFSF12O43508 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TNFSF12O43508 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TNFSF12O43508 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TNFSF12O43508 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
TNFSF12O43508 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
TNFSF12O43508 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TNFSF12O43508 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TNFSF12O43508 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TNFSF12O43508 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TNFSF12O43508 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TNFSF12O43508 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TNFSF12O43508 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TNFSF12O43508 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TNFSF12O43508 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TNFSF12O43508 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TNFSF12O43508 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TNFSF12O43508 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
TNFSF12O43508 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TNFSF12O43508 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TNFSF12O43508 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TNFSF12O43508 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TNFSF12O43508 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TNFSF12O43508 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TNFSF12O43508 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TNFSF12O43508 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TNFSF12O43508 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TNFSF12O43508 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TNFSF12O43508 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TNFSF12O43508 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TNFSF12O43508 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TNFSF12O43508 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TNFSF12O43508 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TNFSF12O43508 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TNFSF12O43508 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TNFSF12O43508 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TNFSF12O43508 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TNFSF12O43508 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TNFSF12O43508 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TNFSF12O43508 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
TNFSF12O43508 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TNFSF12O43508 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TNFSF12O43508 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TNFSF12O43508 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TNFSF12O43508 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TNFSF12O43508 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TNFSF12O43508 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TNFSF12O43508 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TNFSF12O43508 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TNFSF12O43508 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TNFSF12O43508 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TNFSF12O43508 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TNFSF12O43508 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
TNFSF12O43508 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TNFSF12O43508 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TNFSF12O43508 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TNFSF12O43508 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TNFSF12O43508 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TNFSF12O43508 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TNFSF12O43508 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TNFSF12O43508 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TNFSF12O43508 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TNFSF12O43508 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TNFSF12O43508 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TNFSF12O43508 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TNFSF12O43508 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TNFSF12O43508 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TNFSF12O43508 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TNFSF12O43508 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms