Protein–RNA interactions for Protein: O43347

MSI1, RNA-binding protein Musashi homolog 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSI1O43347 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
MSI1O43347 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
MSI1O43347 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
MSI1O43347 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
MSI1O43347 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
MSI1O43347 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
MSI1O43347 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
MSI1O43347 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
MSI1O43347 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
MSI1O43347 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
MSI1O43347 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
MSI1O43347 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
MSI1O43347 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
MSI1O43347 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
MSI1O43347 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
MSI1O43347 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
MSI1O43347 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
MSI1O43347 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
MSI1O43347 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
MSI1O43347 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
MSI1O43347 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
MSI1O43347 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
MSI1O43347 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
MSI1O43347 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
MSI1O43347 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
MSI1O43347 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
MSI1O43347 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
MSI1O43347 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
MSI1O43347 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
MSI1O43347 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
MSI1O43347 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
MSI1O43347 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
MSI1O43347 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
MSI1O43347 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
MSI1O43347 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
MSI1O43347 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
MSI1O43347 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
MSI1O43347 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
MSI1O43347 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
MSI1O43347 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
MSI1O43347 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
MSI1O43347 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
MSI1O43347 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
MSI1O43347 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
MSI1O43347 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
MSI1O43347 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
MSI1O43347 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
MSI1O43347 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
MSI1O43347 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
MSI1O43347 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
MSI1O43347 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
MSI1O43347 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
MSI1O43347 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
MSI1O43347 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
MSI1O43347 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
MSI1O43347 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
MSI1O43347 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
MSI1O43347 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
MSI1O43347 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
MSI1O43347 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
MSI1O43347 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
MSI1O43347 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
MSI1O43347 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
MSI1O43347 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
MSI1O43347 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
MSI1O43347 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
MSI1O43347 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
MSI1O43347 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
MSI1O43347 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
MSI1O43347 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
MSI1O43347 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
MSI1O43347 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
MSI1O43347 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
MSI1O43347 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
MSI1O43347 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
MSI1O43347 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
MSI1O43347 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
MSI1O43347 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
MSI1O43347 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
MSI1O43347 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
MSI1O43347 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
MSI1O43347 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
MSI1O43347 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
MSI1O43347 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
MSI1O43347 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
MSI1O43347 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
MSI1O43347 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
MSI1O43347 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
MSI1O43347 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
MSI1O43347 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.94
MSI1O43347 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
MSI1O43347 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC27.13■■□□□ 1.93
MSI1O43347 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
MSI1O43347 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
MSI1O43347 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
MSI1O43347 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
MSI1O43347 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
MSI1O43347 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
MSI1O43347 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
MSI1O43347 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms