Protein–RNA interactions for Protein: O43309

ZSCAN12, Zinc finger and SCAN domain-containing protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZSCAN12O43309 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
ZSCAN12O43309 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
ZSCAN12O43309 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
ZSCAN12O43309 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
ZSCAN12O43309 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
ZSCAN12O43309 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
ZSCAN12O43309 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
ZSCAN12O43309 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
ZSCAN12O43309 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
ZSCAN12O43309 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
ZSCAN12O43309 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
ZSCAN12O43309 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ZSCAN12O43309 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ZSCAN12O43309 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
ZSCAN12O43309 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
ZSCAN12O43309 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
ZSCAN12O43309 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ZSCAN12O43309 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
ZSCAN12O43309 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
ZSCAN12O43309 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
ZSCAN12O43309 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
ZSCAN12O43309 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
ZSCAN12O43309 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
ZSCAN12O43309 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
ZSCAN12O43309 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
ZSCAN12O43309 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
ZSCAN12O43309 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
ZSCAN12O43309 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
ZSCAN12O43309 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
ZSCAN12O43309 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
ZSCAN12O43309 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ZSCAN12O43309 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ZSCAN12O43309 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ZSCAN12O43309 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
ZSCAN12O43309 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
ZSCAN12O43309 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
ZSCAN12O43309 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
ZSCAN12O43309 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
ZSCAN12O43309 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
ZSCAN12O43309 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ZSCAN12O43309 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ZSCAN12O43309 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ZSCAN12O43309 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ZSCAN12O43309 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
ZSCAN12O43309 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
ZSCAN12O43309 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
ZSCAN12O43309 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
ZSCAN12O43309 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
ZSCAN12O43309 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
ZSCAN12O43309 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
ZSCAN12O43309 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC28.19■■■□□ 2.1
ZSCAN12O43309 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ZSCAN12O43309 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ZSCAN12O43309 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
ZSCAN12O43309 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ZSCAN12O43309 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
ZSCAN12O43309 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
ZSCAN12O43309 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
ZSCAN12O43309 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
ZSCAN12O43309 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
ZSCAN12O43309 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
ZSCAN12O43309 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
ZSCAN12O43309 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
ZSCAN12O43309 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
ZSCAN12O43309 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
ZSCAN12O43309 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
ZSCAN12O43309 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
ZSCAN12O43309 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
ZSCAN12O43309 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ZSCAN12O43309 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ZSCAN12O43309 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ZSCAN12O43309 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ZSCAN12O43309 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
ZSCAN12O43309 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ZSCAN12O43309 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ZSCAN12O43309 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
ZSCAN12O43309 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC28.1■■■□□ 2.09
ZSCAN12O43309 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
ZSCAN12O43309 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ZSCAN12O43309 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
ZSCAN12O43309 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
ZSCAN12O43309 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
ZSCAN12O43309 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ZSCAN12O43309 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
ZSCAN12O43309 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ZSCAN12O43309 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ZSCAN12O43309 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ZSCAN12O43309 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ZSCAN12O43309 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
ZSCAN12O43309 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
ZSCAN12O43309 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
ZSCAN12O43309 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC28.05■■■□□ 2.08
ZSCAN12O43309 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
ZSCAN12O43309 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
ZSCAN12O43309 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ZSCAN12O43309 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ZSCAN12O43309 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ZSCAN12O43309 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ZSCAN12O43309 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
ZSCAN12O43309 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.6 ms