Protein–RNA interactions for Protein: O43272

PRODH, Proline dehydrogenase 1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 600 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRODHO43272 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PRODHO43272 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PRODHO43272 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PRODHO43272 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PRODHO43272 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PRODHO43272 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PRODHO43272 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
PRODHO43272 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PRODHO43272 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRODHO43272 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRODHO43272 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRODHO43272 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRODHO43272 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRODHO43272 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRODHO43272 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRODHO43272 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRODHO43272 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRODHO43272 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PRODHO43272 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PRODHO43272 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
PRODHO43272 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PRODHO43272 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PRODHO43272 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PRODHO43272 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PRODHO43272 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PRODHO43272 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PRODHO43272 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PRODHO43272 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
PRODHO43272 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PRODHO43272 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PRODHO43272 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PRODHO43272 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRODHO43272 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRODHO43272 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRODHO43272 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRODHO43272 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRODHO43272 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRODHO43272 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRODHO43272 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRODHO43272 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRODHO43272 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRODHO43272 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRODHO43272 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRODHO43272 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRODHO43272 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRODHO43272 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
PRODHO43272 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRODHO43272 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRODHO43272 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRODHO43272 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
PRODHO43272 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PRODHO43272 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRODHO43272 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRODHO43272 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRODHO43272 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRODHO43272 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRODHO43272 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRODHO43272 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRODHO43272 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRODHO43272 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRODHO43272 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRODHO43272 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRODHO43272 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRODHO43272 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRODHO43272 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRODHO43272 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRODHO43272 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRODHO43272 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRODHO43272 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRODHO43272 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRODHO43272 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRODHO43272 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
PRODHO43272 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRODHO43272 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRODHO43272 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRODHO43272 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRODHO43272 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRODHO43272 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRODHO43272 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRODHO43272 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRODHO43272 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRODHO43272 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PRODHO43272 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRODHO43272 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRODHO43272 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRODHO43272 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRODHO43272 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRODHO43272 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRODHO43272 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRODHO43272 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRODHO43272 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRODHO43272 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
PRODHO43272 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRODHO43272 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRODHO43272 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRODHO43272 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRODHO43272 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRODHO43272 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRODHO43272 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRODHO43272 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms