Protein–RNA interactions for Protein: O43186

CRX, Cone-rod homeobox protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 299 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRXO43186 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CRXO43186 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CRXO43186 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CRXO43186 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CRXO43186 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CRXO43186 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CRXO43186 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CRXO43186 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CRXO43186 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CRXO43186 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CRXO43186 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CRXO43186 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CRXO43186 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CRXO43186 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CRXO43186 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CRXO43186 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CRXO43186 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CRXO43186 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CRXO43186 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CRXO43186 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CRXO43186 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CRXO43186 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CRXO43186 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CRXO43186 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CRXO43186 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CRXO43186 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CRXO43186 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CRXO43186 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CRXO43186 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CRXO43186 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CRXO43186 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CRXO43186 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CRXO43186 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CRXO43186 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CRXO43186 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CRXO43186 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CRXO43186 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CRXO43186 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CRXO43186 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CRXO43186 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CRXO43186 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CRXO43186 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CRXO43186 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CRXO43186 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CRXO43186 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CRXO43186 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CRXO43186 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
CRXO43186 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CRXO43186 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CRXO43186 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CRXO43186 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CRXO43186 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CRXO43186 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CRXO43186 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
CRXO43186 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CRXO43186 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
CRXO43186 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CRXO43186 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CRXO43186 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CRXO43186 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CRXO43186 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CRXO43186 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CRXO43186 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CRXO43186 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CRXO43186 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CRXO43186 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CRXO43186 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CRXO43186 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CRXO43186 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CRXO43186 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
CRXO43186 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CRXO43186 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CRXO43186 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CRXO43186 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CRXO43186 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CRXO43186 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CRXO43186 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CRXO43186 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CRXO43186 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CRXO43186 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CRXO43186 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CRXO43186 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CRXO43186 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CRXO43186 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CRXO43186 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CRXO43186 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CRXO43186 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CRXO43186 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CRXO43186 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CRXO43186 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CRXO43186 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
CRXO43186 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CRXO43186 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
CRXO43186 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CRXO43186 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CRXO43186 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CRXO43186 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CRXO43186 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CRXO43186 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CRXO43186 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
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