Protein–RNA interactions for Protein: O15511

ARPC5, Actin-related protein 2/3 complex subunit 5, humanhuman

Predictions only

Length 151 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARPC5O15511 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ARPC5O15511 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ARPC5O15511 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ARPC5O15511 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ARPC5O15511 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ARPC5O15511 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ARPC5O15511 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ARPC5O15511 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ARPC5O15511 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ARPC5O15511 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ARPC5O15511 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ARPC5O15511 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ARPC5O15511 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ARPC5O15511 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ARPC5O15511 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ARPC5O15511 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ARPC5O15511 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ARPC5O15511 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ARPC5O15511 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
ARPC5O15511 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ARPC5O15511 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ARPC5O15511 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ARPC5O15511 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ARPC5O15511 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ARPC5O15511 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ARPC5O15511 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ARPC5O15511 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.08
ARPC5O15511 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ARPC5O15511 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ARPC5O15511 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ARPC5O15511 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ARPC5O15511 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ARPC5O15511 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ARPC5O15511 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ARPC5O15511 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ARPC5O15511 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ARPC5O15511 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ARPC5O15511 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ARPC5O15511 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ARPC5O15511 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ARPC5O15511 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ARPC5O15511 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ARPC5O15511 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ARPC5O15511 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ARPC5O15511 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ARPC5O15511 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
ARPC5O15511 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ARPC5O15511 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ARPC5O15511 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ARPC5O15511 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ARPC5O15511 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ARPC5O15511 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ARPC5O15511 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ARPC5O15511 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ARPC5O15511 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ARPC5O15511 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ARPC5O15511 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
ARPC5O15511 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ARPC5O15511 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ARPC5O15511 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ARPC5O15511 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ARPC5O15511 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ARPC5O15511 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ARPC5O15511 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
ARPC5O15511 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ARPC5O15511 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ARPC5O15511 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ARPC5O15511 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ARPC5O15511 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ARPC5O15511 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ARPC5O15511 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ARPC5O15511 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ARPC5O15511 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
ARPC5O15511 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ARPC5O15511 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ARPC5O15511 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ARPC5O15511 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ARPC5O15511 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ARPC5O15511 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ARPC5O15511 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ARPC5O15511 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ARPC5O15511 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ARPC5O15511 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ARPC5O15511 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ARPC5O15511 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ARPC5O15511 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ARPC5O15511 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ARPC5O15511 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ARPC5O15511 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
ARPC5O15511 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
ARPC5O15511 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ARPC5O15511 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ARPC5O15511 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ARPC5O15511 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ARPC5O15511 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ARPC5O15511 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ARPC5O15511 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ARPC5O15511 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ARPC5O15511 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ARPC5O15511 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.5 ms