Protein–RNA interactions for Protein: O15260

SURF4, Surfeit locus protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SURF4O15260 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SURF4O15260 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SURF4O15260 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SURF4O15260 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SURF4O15260 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SURF4O15260 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SURF4O15260 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SURF4O15260 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SURF4O15260 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SURF4O15260 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SURF4O15260 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SURF4O15260 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SURF4O15260 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SURF4O15260 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SURF4O15260 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SURF4O15260 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SURF4O15260 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SURF4O15260 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SURF4O15260 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SURF4O15260 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SURF4O15260 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SURF4O15260 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
SURF4O15260 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SURF4O15260 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SURF4O15260 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
SURF4O15260 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SURF4O15260 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SURF4O15260 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SURF4O15260 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SURF4O15260 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SURF4O15260 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SURF4O15260 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
SURF4O15260 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SURF4O15260 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SURF4O15260 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SURF4O15260 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SURF4O15260 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SURF4O15260 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SURF4O15260 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SURF4O15260 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
SURF4O15260 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SURF4O15260 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SURF4O15260 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SURF4O15260 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SURF4O15260 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SURF4O15260 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SURF4O15260 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SURF4O15260 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SURF4O15260 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SURF4O15260 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SURF4O15260 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SURF4O15260 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SURF4O15260 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SURF4O15260 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SURF4O15260 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SURF4O15260 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SURF4O15260 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SURF4O15260 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SURF4O15260 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SURF4O15260 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SURF4O15260 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SURF4O15260 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SURF4O15260 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SURF4O15260 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SURF4O15260 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SURF4O15260 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SURF4O15260 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SURF4O15260 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SURF4O15260 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SURF4O15260 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SURF4O15260 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SURF4O15260 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SURF4O15260 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SURF4O15260 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SURF4O15260 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SURF4O15260 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SURF4O15260 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SURF4O15260 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SURF4O15260 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SURF4O15260 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SURF4O15260 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SURF4O15260 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SURF4O15260 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SURF4O15260 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SURF4O15260 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
SURF4O15260 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SURF4O15260 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SURF4O15260 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SURF4O15260 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SURF4O15260 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SURF4O15260 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SURF4O15260 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SURF4O15260 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SURF4O15260 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SURF4O15260 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SURF4O15260 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SURF4O15260 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SURF4O15260 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SURF4O15260 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SURF4O15260 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.1 ms