Protein–RNA interactions for Protein: O15228

GNPAT, Dihydroxyacetone phosphate acyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 680 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNPATO15228 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
GNPATO15228 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
GNPATO15228 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC34.08■■■■□ 3.05
GNPATO15228 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.07■■■■□ 3.05
GNPATO15228 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
GNPATO15228 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC34.07■■■■□ 3.04
GNPATO15228 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC34.06■■■■□ 3.04
GNPATO15228 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC34.06■■■■□ 3.04
GNPATO15228 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC34.06■■■■□ 3.04
GNPATO15228 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC34.05■■■■□ 3.04
GNPATO15228 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
GNPATO15228 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.04■■■■□ 3.04
GNPATO15228 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.02■■■■□ 3.04
GNPATO15228 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC34.02■■■■□ 3.04
GNPATO15228 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
GNPATO15228 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC34.01■■■■□ 3.04
GNPATO15228 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC34■■■■□ 3.03
GNPATO15228 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC33.99■■■■□ 3.03
GNPATO15228 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC33.99■■■■□ 3.03
GNPATO15228 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
GNPATO15228 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC33.97■■■■□ 3.03
GNPATO15228 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC33.97■■■■□ 3.03
GNPATO15228 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC33.97■■■■□ 3.03
GNPATO15228 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC33.96■■■■□ 3.03
GNPATO15228 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC33.95■■■■□ 3.03
GNPATO15228 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
GNPATO15228 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
GNPATO15228 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC33.92■■■■□ 3.02
GNPATO15228 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.92■■■■□ 3.02
GNPATO15228 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
GNPATO15228 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
GNPATO15228 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
GNPATO15228 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC33.91■■■■□ 3.02
GNPATO15228 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
GNPATO15228 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
GNPATO15228 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
GNPATO15228 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
GNPATO15228 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
GNPATO15228 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
GNPATO15228 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
GNPATO15228 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
GNPATO15228 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC33.86■■■■□ 3.01
GNPATO15228 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
GNPATO15228 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
GNPATO15228 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC33.85■■■■□ 3.01
GNPATO15228 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
GNPATO15228 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
GNPATO15228 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
GNPATO15228 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
GNPATO15228 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC33.83■■■■□ 3.01
GNPATO15228 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.83■■■■□ 3.01
GNPATO15228 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
GNPATO15228 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC33.82■■■■□ 3
GNPATO15228 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
GNPATO15228 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.81■■■■□ 3
GNPATO15228 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC33.81■■■■□ 3
GNPATO15228 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
GNPATO15228 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.8■■■■□ 3
GNPATO15228 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
GNPATO15228 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
GNPATO15228 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
GNPATO15228 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
GNPATO15228 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
GNPATO15228 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
GNPATO15228 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC33.79■■■■□ 3
GNPATO15228 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
GNPATO15228 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC33.78■■■■□ 3
GNPATO15228 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC33.78■■■■□ 3
GNPATO15228 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC33.78■■■■□ 3
GNPATO15228 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.76■■■□□ 2.99
GNPATO15228 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
GNPATO15228 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
GNPATO15228 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
GNPATO15228 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
GNPATO15228 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
GNPATO15228 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
GNPATO15228 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC33.72■■■□□ 2.99
GNPATO15228 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
GNPATO15228 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
GNPATO15228 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC33.71■■■□□ 2.99
GNPATO15228 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC33.71■■■□□ 2.99
GNPATO15228 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC33.71■■■□□ 2.99
GNPATO15228 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC33.71■■■□□ 2.99
GNPATO15228 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
GNPATO15228 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
GNPATO15228 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC33.69■■■□□ 2.98
GNPATO15228 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC33.69■■■□□ 2.98
GNPATO15228 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
GNPATO15228 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC33.68■■■□□ 2.98
GNPATO15228 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
GNPATO15228 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
GNPATO15228 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC33.67■■■□□ 2.98
GNPATO15228 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
GNPATO15228 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.65■■■□□ 2.98
GNPATO15228 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC33.65■■■□□ 2.98
GNPATO15228 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC33.63■■■□□ 2.97
GNPATO15228 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
GNPATO15228 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC33.62■■■□□ 2.97
GNPATO15228 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
GNPATO15228 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.61■■■□□ 2.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.9 ms