Protein–RNA interactions for Protein: O14874

BCKDK, [3-methyl-2-oxobutanoate dehydrogenase [lipoamide]] kinase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCKDKO14874 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
BCKDKO14874 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
BCKDKO14874 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
BCKDKO14874 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.66■■□□□ 1.54
BCKDKO14874 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
BCKDKO14874 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
BCKDKO14874 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
BCKDKO14874 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
BCKDKO14874 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
BCKDKO14874 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
BCKDKO14874 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
BCKDKO14874 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
BCKDKO14874 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
BCKDKO14874 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.53
BCKDKO14874 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
BCKDKO14874 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
BCKDKO14874 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
BCKDKO14874 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
BCKDKO14874 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
BCKDKO14874 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
BCKDKO14874 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
BCKDKO14874 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
BCKDKO14874 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
BCKDKO14874 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
BCKDKO14874 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
BCKDKO14874 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
BCKDKO14874 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
BCKDKO14874 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
BCKDKO14874 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
BCKDKO14874 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
BCKDKO14874 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
BCKDKO14874 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
BCKDKO14874 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
BCKDKO14874 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
BCKDKO14874 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
BCKDKO14874 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
BCKDKO14874 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
BCKDKO14874 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
BCKDKO14874 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
BCKDKO14874 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
BCKDKO14874 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
BCKDKO14874 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
BCKDKO14874 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
BCKDKO14874 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
BCKDKO14874 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
BCKDKO14874 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
BCKDKO14874 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
BCKDKO14874 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
BCKDKO14874 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
BCKDKO14874 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
BCKDKO14874 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
BCKDKO14874 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
BCKDKO14874 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
BCKDKO14874 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
BCKDKO14874 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
BCKDKO14874 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
BCKDKO14874 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
BCKDKO14874 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
BCKDKO14874 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
BCKDKO14874 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
BCKDKO14874 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
BCKDKO14874 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
BCKDKO14874 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
BCKDKO14874 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
BCKDKO14874 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
BCKDKO14874 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
BCKDKO14874 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
BCKDKO14874 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
BCKDKO14874 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
BCKDKO14874 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
BCKDKO14874 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
BCKDKO14874 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
BCKDKO14874 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
BCKDKO14874 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
BCKDKO14874 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
BCKDKO14874 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
BCKDKO14874 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
BCKDKO14874 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
BCKDKO14874 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
BCKDKO14874 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
BCKDKO14874 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
BCKDKO14874 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
BCKDKO14874 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
BCKDKO14874 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
BCKDKO14874 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
BCKDKO14874 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
BCKDKO14874 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
BCKDKO14874 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
BCKDKO14874 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
BCKDKO14874 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
BCKDKO14874 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
BCKDKO14874 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
BCKDKO14874 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
BCKDKO14874 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
BCKDKO14874 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
BCKDKO14874 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
BCKDKO14874 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
BCKDKO14874 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
BCKDKO14874 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
BCKDKO14874 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 7.9 ms