Protein–RNA interactions for Protein: O14522

PTPRT, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, humanhuman

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Length 1,441 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRTO14522 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC39.29■■■■□ 3.88
PTPRTO14522 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC39.28■■■■□ 3.88
PTPRTO14522 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC39.27■■■■□ 3.88
PTPRTO14522 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC39.26■■■■□ 3.88
PTPRTO14522 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.24■■■■□ 3.87
PTPRTO14522 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC39.22■■■■□ 3.87
PTPRTO14522 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.21■■■■□ 3.87
PTPRTO14522 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC39.21■■■■□ 3.87
PTPRTO14522 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC39.2■■■■□ 3.87
PTPRTO14522 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.2■■■■□ 3.87
PTPRTO14522 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.2■■■■□ 3.87
PTPRTO14522 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC39.2■■■■□ 3.87
PTPRTO14522 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC39.19■■■■□ 3.86
PTPRTO14522 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC39.19■■■■□ 3.86
PTPRTO14522 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC39.18■■■■□ 3.86
PTPRTO14522 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC39.18■■■■□ 3.86
PTPRTO14522 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC39.18■■■■□ 3.86
PTPRTO14522 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC39.17■■■■□ 3.86
PTPRTO14522 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC39.17■■■■□ 3.86
PTPRTO14522 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC39.16■■■■□ 3.86
PTPRTO14522 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC39.15■■■■□ 3.86
PTPRTO14522 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC39.15■■■■□ 3.86
PTPRTO14522 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC39.14■■■■□ 3.86
PTPRTO14522 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC39.14■■■■□ 3.86
PTPRTO14522 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.12■■■■□ 3.85
PTPRTO14522 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC39.12■■■■□ 3.85
PTPRTO14522 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.12■■■■□ 3.85
PTPRTO14522 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.12■■■■□ 3.85
PTPRTO14522 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.11■■■■□ 3.85
PTPRTO14522 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC39.11■■■■□ 3.85
PTPRTO14522 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC39.11■■■■□ 3.85
PTPRTO14522 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.1■■■■□ 3.85
PTPRTO14522 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC39.1■■■■□ 3.85
PTPRTO14522 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.1■■■■□ 3.85
PTPRTO14522 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC39.1■■■■□ 3.85
PTPRTO14522 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC39.09■■■■□ 3.85
PTPRTO14522 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC39.09■■■■□ 3.85
PTPRTO14522 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC39.09■■■■□ 3.85
PTPRTO14522 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC39.09■■■■□ 3.85
PTPRTO14522 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC39.09■■■■□ 3.85
PTPRTO14522 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC39.09■■■■□ 3.85
PTPRTO14522 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC39.09■■■■□ 3.85
PTPRTO14522 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC39.09■■■■□ 3.85
PTPRTO14522 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC39.09■■■■□ 3.85
PTPRTO14522 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC39.09■■■■□ 3.85
PTPRTO14522 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC39.09■■■■□ 3.85
PTPRTO14522 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.09■■■■□ 3.85
PTPRTO14522 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC39.09■■■■□ 3.85
PTPRTO14522 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC39.09■■■■□ 3.85
PTPRTO14522 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC39.09■■■■□ 3.85
PTPRTO14522 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.09■■■■□ 3.85
PTPRTO14522 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.09■■■■□ 3.85
PTPRTO14522 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.08■■■■□ 3.85
PTPRTO14522 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.07■■■■□ 3.84
PTPRTO14522 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.06■■■■□ 3.84
PTPRTO14522 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.06■■■■□ 3.84
PTPRTO14522 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC39.06■■■■□ 3.84
PTPRTO14522 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC39.05■■■■□ 3.84
PTPRTO14522 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC39.05■■■■□ 3.84
PTPRTO14522 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.04■■■■□ 3.84
PTPRTO14522 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC39.04■■■■□ 3.84
PTPRTO14522 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC39.03■■■■□ 3.84
PTPRTO14522 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC39.02■■■■□ 3.84
PTPRTO14522 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.01■■■■□ 3.83
PTPRTO14522 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39■■■■□ 3.83
PTPRTO14522 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39■■■■□ 3.83
PTPRTO14522 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC38.99■■■■□ 3.83
PTPRTO14522 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC38.99■■■■□ 3.83
PTPRTO14522 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC38.98■■■■□ 3.83
PTPRTO14522 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC38.98■■■■□ 3.83
PTPRTO14522 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.98■■■■□ 3.83
PTPRTO14522 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC38.98■■■■□ 3.83
PTPRTO14522 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC38.97■■■■□ 3.83
PTPRTO14522 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.97■■■■□ 3.83
PTPRTO14522 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.97■■■■□ 3.83
PTPRTO14522 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC38.95■■■■□ 3.83
PTPRTO14522 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.95■■■■□ 3.83
PTPRTO14522 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.95■■■■□ 3.83
PTPRTO14522 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.95■■■■□ 3.83
PTPRTO14522 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.93■■■■□ 3.82
PTPRTO14522 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC38.92■■■■□ 3.82
PTPRTO14522 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.92■■■■□ 3.82
PTPRTO14522 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC38.91■■■■□ 3.82
PTPRTO14522 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.91■■■■□ 3.82
PTPRTO14522 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.9■■■■□ 3.82
PTPRTO14522 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.89■■■■□ 3.82
PTPRTO14522 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.89■■■■□ 3.82
PTPRTO14522 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC38.88■■■■□ 3.82
PTPRTO14522 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC38.88■■■■□ 3.81
PTPRTO14522 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC38.86■■■■□ 3.81
PTPRTO14522 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC38.85■■■■□ 3.81
PTPRTO14522 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.84■■■■□ 3.81
PTPRTO14522 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC38.83■■■■□ 3.81
PTPRTO14522 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.82■■■■□ 3.81
PTPRTO14522 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.82■■■■□ 3.81
PTPRTO14522 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC38.82■■■■□ 3.81
PTPRTO14522 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.82■■■■□ 3.81
PTPRTO14522 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.82■■■■□ 3.81
PTPRTO14522 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC38.81■■■■□ 3.8
PTPRTO14522 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC38.81■■■■□ 3.8
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