Protein–RNA interactions for Protein: O14497

ARID1A, AT-rich interactive domain-containing protein 1A, humanhuman

Predictions only

Length 2,285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID1AO14497 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ARID1AO14497 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
ARID1AO14497 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ARID1AO14497 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ARID1AO14497 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ARID1AO14497 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ARID1AO14497 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ARID1AO14497 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ARID1AO14497 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ARID1AO14497 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ARID1AO14497 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ARID1AO14497 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ARID1AO14497 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
ARID1AO14497 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ARID1AO14497 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ARID1AO14497 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ARID1AO14497 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ARID1AO14497 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ARID1AO14497 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ARID1AO14497 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ARID1AO14497 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ARID1AO14497 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
ARID1AO14497 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ARID1AO14497 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
ARID1AO14497 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ARID1AO14497 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
ARID1AO14497 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.23
ARID1AO14497 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ARID1AO14497 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ARID1AO14497 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ARID1AO14497 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ARID1AO14497 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ARID1AO14497 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ARID1AO14497 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ARID1AO14497 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ARID1AO14497 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ARID1AO14497 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ARID1AO14497 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ARID1AO14497 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ARID1AO14497 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ARID1AO14497 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
ARID1AO14497 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ARID1AO14497 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ARID1AO14497 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ARID1AO14497 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ARID1AO14497 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ARID1AO14497 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ARID1AO14497 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ARID1AO14497 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ARID1AO14497 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ARID1AO14497 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
ARID1AO14497 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
ARID1AO14497 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
ARID1AO14497 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ARID1AO14497 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ARID1AO14497 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ARID1AO14497 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ARID1AO14497 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ARID1AO14497 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ARID1AO14497 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
ARID1AO14497 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ARID1AO14497 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ARID1AO14497 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ARID1AO14497 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ARID1AO14497 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ARID1AO14497 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ARID1AO14497 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ARID1AO14497 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ARID1AO14497 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ARID1AO14497 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ARID1AO14497 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ARID1AO14497 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ARID1AO14497 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ARID1AO14497 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
ARID1AO14497 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ARID1AO14497 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ARID1AO14497 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
ARID1AO14497 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
ARID1AO14497 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
ARID1AO14497 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
ARID1AO14497 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ARID1AO14497 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ARID1AO14497 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ARID1AO14497 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ARID1AO14497 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ARID1AO14497 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ARID1AO14497 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ARID1AO14497 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ARID1AO14497 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ARID1AO14497 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ARID1AO14497 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ARID1AO14497 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ARID1AO14497 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ARID1AO14497 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ARID1AO14497 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ARID1AO14497 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ARID1AO14497 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ARID1AO14497 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ARID1AO14497 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ARID1AO14497 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.5 ms