Protein–RNA interactions for Protein: O00469

PLOD2, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 2, humanhuman

Predictions only

Length 737 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLOD2O00469 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PLOD2O00469 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
PLOD2O00469 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PLOD2O00469 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25■■□□□ 1.59
PLOD2O00469 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
PLOD2O00469 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC25■■□□□ 1.59
PLOD2O00469 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PLOD2O00469 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
PLOD2O00469 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PLOD2O00469 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PLOD2O00469 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PLOD2O00469 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PLOD2O00469 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PLOD2O00469 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PLOD2O00469 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PLOD2O00469 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PLOD2O00469 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PLOD2O00469 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PLOD2O00469 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PLOD2O00469 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PLOD2O00469 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PLOD2O00469 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PLOD2O00469 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PLOD2O00469 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PLOD2O00469 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PLOD2O00469 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PLOD2O00469 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PLOD2O00469 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PLOD2O00469 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PLOD2O00469 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PLOD2O00469 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PLOD2O00469 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PLOD2O00469 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PLOD2O00469 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PLOD2O00469 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PLOD2O00469 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PLOD2O00469 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PLOD2O00469 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PLOD2O00469 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PLOD2O00469 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PLOD2O00469 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PLOD2O00469 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PLOD2O00469 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PLOD2O00469 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PLOD2O00469 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PLOD2O00469 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PLOD2O00469 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PLOD2O00469 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
PLOD2O00469 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.57
PLOD2O00469 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PLOD2O00469 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PLOD2O00469 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PLOD2O00469 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PLOD2O00469 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PLOD2O00469 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
PLOD2O00469 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PLOD2O00469 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PLOD2O00469 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PLOD2O00469 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PLOD2O00469 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PLOD2O00469 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PLOD2O00469 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PLOD2O00469 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PLOD2O00469 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PLOD2O00469 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PLOD2O00469 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PLOD2O00469 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PLOD2O00469 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PLOD2O00469 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PLOD2O00469 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PLOD2O00469 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PLOD2O00469 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PLOD2O00469 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PLOD2O00469 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PLOD2O00469 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PLOD2O00469 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PLOD2O00469 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PLOD2O00469 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PLOD2O00469 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
PLOD2O00469 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PLOD2O00469 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PLOD2O00469 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PLOD2O00469 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PLOD2O00469 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PLOD2O00469 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PLOD2O00469 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PLOD2O00469 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PLOD2O00469 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PLOD2O00469 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PLOD2O00469 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PLOD2O00469 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PLOD2O00469 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PLOD2O00469 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PLOD2O00469 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
PLOD2O00469 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PLOD2O00469 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PLOD2O00469 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PLOD2O00469 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PLOD2O00469 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PLOD2O00469 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms