Protein–RNA interactions for Protein: O00411

POLRMT, DNA-directed RNA polymerase, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLRMTO00411 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.57■■■□□ 2.96
POLRMTO00411 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC33.56■■■□□ 2.96
POLRMTO00411 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC33.56■■■□□ 2.96
POLRMTO00411 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC33.55■■■□□ 2.96
POLRMTO00411 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
POLRMTO00411 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
POLRMTO00411 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.54■■■□□ 2.96
POLRMTO00411 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
POLRMTO00411 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
POLRMTO00411 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC33.53■■■□□ 2.96
POLRMTO00411 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.52■■■□□ 2.96
POLRMTO00411 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC33.52■■■□□ 2.96
POLRMTO00411 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
POLRMTO00411 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.49■■■□□ 2.95
POLRMTO00411 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC33.48■■■□□ 2.95
POLRMTO00411 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC33.47■■■□□ 2.95
POLRMTO00411 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC33.47■■■□□ 2.95
POLRMTO00411 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC33.47■■■□□ 2.95
POLRMTO00411 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC33.46■■■□□ 2.95
POLRMTO00411 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC33.44■■■□□ 2.94
POLRMTO00411 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC33.42■■■□□ 2.94
POLRMTO00411 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
POLRMTO00411 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC33.42■■■□□ 2.94
POLRMTO00411 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC33.42■■■□□ 2.94
POLRMTO00411 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC33.42■■■□□ 2.94
POLRMTO00411 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC33.41■■■□□ 2.94
POLRMTO00411 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
POLRMTO00411 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.39■■■□□ 2.94
POLRMTO00411 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
POLRMTO00411 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
POLRMTO00411 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
POLRMTO00411 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
POLRMTO00411 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
POLRMTO00411 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
POLRMTO00411 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
POLRMTO00411 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
POLRMTO00411 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
POLRMTO00411 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC33.37■■■□□ 2.93
POLRMTO00411 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
POLRMTO00411 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
POLRMTO00411 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.35■■■□□ 2.93
POLRMTO00411 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.35■■■□□ 2.93
POLRMTO00411 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
POLRMTO00411 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
POLRMTO00411 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
POLRMTO00411 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
POLRMTO00411 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC33.33■■■□□ 2.93
POLRMTO00411 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
POLRMTO00411 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC33.32■■■□□ 2.92
POLRMTO00411 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.31■■■□□ 2.92
POLRMTO00411 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
POLRMTO00411 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
POLRMTO00411 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
POLRMTO00411 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
POLRMTO00411 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC33.3■■■□□ 2.92
POLRMTO00411 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC33.3■■■□□ 2.92
POLRMTO00411 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
POLRMTO00411 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC33.3■■■□□ 2.92
POLRMTO00411 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
POLRMTO00411 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
POLRMTO00411 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
POLRMTO00411 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC33.27■■■□□ 2.92
POLRMTO00411 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC33.27■■■□□ 2.92
POLRMTO00411 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
POLRMTO00411 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
POLRMTO00411 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC33.25■■■□□ 2.91
POLRMTO00411 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
POLRMTO00411 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC33.22■■■□□ 2.91
POLRMTO00411 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.22■■■□□ 2.91
POLRMTO00411 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
POLRMTO00411 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC33.2■■■□□ 2.91
POLRMTO00411 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
POLRMTO00411 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC33.19■■■□□ 2.9
POLRMTO00411 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
POLRMTO00411 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
POLRMTO00411 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC33.18■■■□□ 2.9
POLRMTO00411 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC33.18■■■□□ 2.9
POLRMTO00411 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
POLRMTO00411 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
POLRMTO00411 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
POLRMTO00411 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
POLRMTO00411 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
POLRMTO00411 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
POLRMTO00411 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
POLRMTO00411 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC33.17■■■□□ 2.9
POLRMTO00411 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC33.16■■■□□ 2.9
POLRMTO00411 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC33.16■■■□□ 2.9
POLRMTO00411 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC33.16■■■□□ 2.9
POLRMTO00411 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC33.16■■■□□ 2.9
POLRMTO00411 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
POLRMTO00411 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC33.14■■■□□ 2.9
POLRMTO00411 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
POLRMTO00411 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
POLRMTO00411 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.12■■■□□ 2.89
POLRMTO00411 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC33.12■■■□□ 2.89
POLRMTO00411 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
POLRMTO00411 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
POLRMTO00411 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC33.09■■■□□ 2.89
POLRMTO00411 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.09■■■□□ 2.89
POLRMTO00411 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC33.08■■■□□ 2.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms