Protein–RNA interactions for Protein: H3BV60

TGFBR3L, Transforming growth factor-beta receptor type 3-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGFBR3LH3BV60 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TGFBR3LH3BV60 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TGFBR3LH3BV60 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TGFBR3LH3BV60 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TGFBR3LH3BV60 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
TGFBR3LH3BV60 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TGFBR3LH3BV60 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TGFBR3LH3BV60 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TGFBR3LH3BV60 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TGFBR3LH3BV60 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TGFBR3LH3BV60 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
TGFBR3LH3BV60 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
TGFBR3LH3BV60 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TGFBR3LH3BV60 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TGFBR3LH3BV60 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
TGFBR3LH3BV60 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TGFBR3LH3BV60 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TGFBR3LH3BV60 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TGFBR3LH3BV60 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TGFBR3LH3BV60 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TGFBR3LH3BV60 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TGFBR3LH3BV60 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TGFBR3LH3BV60 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TGFBR3LH3BV60 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TGFBR3LH3BV60 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TGFBR3LH3BV60 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TGFBR3LH3BV60 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TGFBR3LH3BV60 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
TGFBR3LH3BV60 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TGFBR3LH3BV60 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
TGFBR3LH3BV60 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TGFBR3LH3BV60 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
TGFBR3LH3BV60 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TGFBR3LH3BV60 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TGFBR3LH3BV60 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TGFBR3LH3BV60 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TGFBR3LH3BV60 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TGFBR3LH3BV60 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TGFBR3LH3BV60 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TGFBR3LH3BV60 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TGFBR3LH3BV60 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TGFBR3LH3BV60 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TGFBR3LH3BV60 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TGFBR3LH3BV60 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TGFBR3LH3BV60 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TGFBR3LH3BV60 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.52
TGFBR3LH3BV60 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
TGFBR3LH3BV60 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TGFBR3LH3BV60 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TGFBR3LH3BV60 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TGFBR3LH3BV60 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TGFBR3LH3BV60 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TGFBR3LH3BV60 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TGFBR3LH3BV60 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TGFBR3LH3BV60 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TGFBR3LH3BV60 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TGFBR3LH3BV60 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TGFBR3LH3BV60 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TGFBR3LH3BV60 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TGFBR3LH3BV60 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TGFBR3LH3BV60 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TGFBR3LH3BV60 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TGFBR3LH3BV60 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TGFBR3LH3BV60 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TGFBR3LH3BV60 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TGFBR3LH3BV60 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TGFBR3LH3BV60 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TGFBR3LH3BV60 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TGFBR3LH3BV60 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TGFBR3LH3BV60 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TGFBR3LH3BV60 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TGFBR3LH3BV60 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
TGFBR3LH3BV60 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TGFBR3LH3BV60 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TGFBR3LH3BV60 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
TGFBR3LH3BV60 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TGFBR3LH3BV60 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TGFBR3LH3BV60 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TGFBR3LH3BV60 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TGFBR3LH3BV60 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TGFBR3LH3BV60 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TGFBR3LH3BV60 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TGFBR3LH3BV60 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TGFBR3LH3BV60 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TGFBR3LH3BV60 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TGFBR3LH3BV60 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TGFBR3LH3BV60 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TGFBR3LH3BV60 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TGFBR3LH3BV60 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TGFBR3LH3BV60 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TGFBR3LH3BV60 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TGFBR3LH3BV60 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TGFBR3LH3BV60 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TGFBR3LH3BV60 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
TGFBR3LH3BV60 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TGFBR3LH3BV60 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TGFBR3LH3BV60 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TGFBR3LH3BV60 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TGFBR3LH3BV60 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TGFBR3LH3BV60 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms