Protein–RNA interactions for Protein: B2RUZ4

SMIM1, Small integral membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 78 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM1B2RUZ4 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SMIM1B2RUZ4 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SMIM1B2RUZ4 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SMIM1B2RUZ4 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
SMIM1B2RUZ4 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SMIM1B2RUZ4 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SMIM1B2RUZ4 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SMIM1B2RUZ4 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SMIM1B2RUZ4 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SMIM1B2RUZ4 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SMIM1B2RUZ4 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SMIM1B2RUZ4 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SMIM1B2RUZ4 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SMIM1B2RUZ4 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SMIM1B2RUZ4 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SMIM1B2RUZ4 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SMIM1B2RUZ4 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SMIM1B2RUZ4 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SMIM1B2RUZ4 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SMIM1B2RUZ4 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SMIM1B2RUZ4 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SMIM1B2RUZ4 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SMIM1B2RUZ4 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SMIM1B2RUZ4 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SMIM1B2RUZ4 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SMIM1B2RUZ4 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
SMIM1B2RUZ4 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SMIM1B2RUZ4 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SMIM1B2RUZ4 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SMIM1B2RUZ4 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SMIM1B2RUZ4 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SMIM1B2RUZ4 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SMIM1B2RUZ4 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SMIM1B2RUZ4 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SMIM1B2RUZ4 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SMIM1B2RUZ4 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SMIM1B2RUZ4 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SMIM1B2RUZ4 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SMIM1B2RUZ4 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SMIM1B2RUZ4 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SMIM1B2RUZ4 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SMIM1B2RUZ4 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SMIM1B2RUZ4 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SMIM1B2RUZ4 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SMIM1B2RUZ4 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SMIM1B2RUZ4 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SMIM1B2RUZ4 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
SMIM1B2RUZ4 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SMIM1B2RUZ4 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SMIM1B2RUZ4 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SMIM1B2RUZ4 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SMIM1B2RUZ4 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SMIM1B2RUZ4 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
SMIM1B2RUZ4 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SMIM1B2RUZ4 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SMIM1B2RUZ4 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SMIM1B2RUZ4 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SMIM1B2RUZ4 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SMIM1B2RUZ4 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SMIM1B2RUZ4 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SMIM1B2RUZ4 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SMIM1B2RUZ4 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SMIM1B2RUZ4 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SMIM1B2RUZ4 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SMIM1B2RUZ4 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SMIM1B2RUZ4 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SMIM1B2RUZ4 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SMIM1B2RUZ4 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SMIM1B2RUZ4 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SMIM1B2RUZ4 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SMIM1B2RUZ4 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SMIM1B2RUZ4 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SMIM1B2RUZ4 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SMIM1B2RUZ4 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SMIM1B2RUZ4 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SMIM1B2RUZ4 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SMIM1B2RUZ4 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SMIM1B2RUZ4 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SMIM1B2RUZ4 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SMIM1B2RUZ4 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
SMIM1B2RUZ4 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
SMIM1B2RUZ4 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SMIM1B2RUZ4 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SMIM1B2RUZ4 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SMIM1B2RUZ4 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SMIM1B2RUZ4 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
SMIM1B2RUZ4 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SMIM1B2RUZ4 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SMIM1B2RUZ4 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SMIM1B2RUZ4 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SMIM1B2RUZ4 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SMIM1B2RUZ4 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SMIM1B2RUZ4 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
SMIM1B2RUZ4 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SMIM1B2RUZ4 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SMIM1B2RUZ4 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SMIM1B2RUZ4 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SMIM1B2RUZ4 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SMIM1B2RUZ4 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
SMIM1B2RUZ4 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms