Protein–RNA interactions for Protein: A6NNX1

RIIAD1, RIIa domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIIAD1A6NNX1 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
RIIAD1A6NNX1 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
RIIAD1A6NNX1 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RIIAD1A6NNX1 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RIIAD1A6NNX1 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
RIIAD1A6NNX1 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RIIAD1A6NNX1 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RIIAD1A6NNX1 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RIIAD1A6NNX1 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RIIAD1A6NNX1 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RIIAD1A6NNX1 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RIIAD1A6NNX1 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
RIIAD1A6NNX1 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RIIAD1A6NNX1 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RIIAD1A6NNX1 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RIIAD1A6NNX1 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RIIAD1A6NNX1 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RIIAD1A6NNX1 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RIIAD1A6NNX1 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RIIAD1A6NNX1 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RIIAD1A6NNX1 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RIIAD1A6NNX1 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RIIAD1A6NNX1 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RIIAD1A6NNX1 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RIIAD1A6NNX1 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RIIAD1A6NNX1 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RIIAD1A6NNX1 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RIIAD1A6NNX1 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RIIAD1A6NNX1 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RIIAD1A6NNX1 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RIIAD1A6NNX1 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RIIAD1A6NNX1 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
RIIAD1A6NNX1 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RIIAD1A6NNX1 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RIIAD1A6NNX1 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RIIAD1A6NNX1 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RIIAD1A6NNX1 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RIIAD1A6NNX1 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RIIAD1A6NNX1 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RIIAD1A6NNX1 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RIIAD1A6NNX1 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RIIAD1A6NNX1 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RIIAD1A6NNX1 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RIIAD1A6NNX1 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RIIAD1A6NNX1 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RIIAD1A6NNX1 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RIIAD1A6NNX1 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RIIAD1A6NNX1 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RIIAD1A6NNX1 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RIIAD1A6NNX1 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
RIIAD1A6NNX1 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RIIAD1A6NNX1 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RIIAD1A6NNX1 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RIIAD1A6NNX1 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RIIAD1A6NNX1 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RIIAD1A6NNX1 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
RIIAD1A6NNX1 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RIIAD1A6NNX1 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RIIAD1A6NNX1 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RIIAD1A6NNX1 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RIIAD1A6NNX1 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RIIAD1A6NNX1 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RIIAD1A6NNX1 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RIIAD1A6NNX1 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RIIAD1A6NNX1 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RIIAD1A6NNX1 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RIIAD1A6NNX1 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RIIAD1A6NNX1 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RIIAD1A6NNX1 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RIIAD1A6NNX1 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RIIAD1A6NNX1 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RIIAD1A6NNX1 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RIIAD1A6NNX1 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RIIAD1A6NNX1 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
RIIAD1A6NNX1 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RIIAD1A6NNX1 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RIIAD1A6NNX1 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RIIAD1A6NNX1 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
RIIAD1A6NNX1 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RIIAD1A6NNX1 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RIIAD1A6NNX1 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RIIAD1A6NNX1 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RIIAD1A6NNX1 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RIIAD1A6NNX1 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RIIAD1A6NNX1 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RIIAD1A6NNX1 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
RIIAD1A6NNX1 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RIIAD1A6NNX1 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RIIAD1A6NNX1 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RIIAD1A6NNX1 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RIIAD1A6NNX1 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RIIAD1A6NNX1 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RIIAD1A6NNX1 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RIIAD1A6NNX1 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RIIAD1A6NNX1 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RIIAD1A6NNX1 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RIIAD1A6NNX1 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RIIAD1A6NNX1 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
RIIAD1A6NNX1 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RIIAD1A6NNX1 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms