Protein–RNA interactions for Protein: A6NLC8

Putative TAF11-like protein ENSP00000332601, humanhuman

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A6NLC8 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
A6NLC8 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
A6NLC8 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
A6NLC8 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
A6NLC8 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
A6NLC8 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
A6NLC8 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
A6NLC8 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
A6NLC8 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
A6NLC8 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
A6NLC8 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
A6NLC8 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
A6NLC8 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
A6NLC8 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
A6NLC8 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
A6NLC8 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
A6NLC8 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
A6NLC8 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
A6NLC8 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
A6NLC8 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
A6NLC8 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
A6NLC8 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
A6NLC8 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
A6NLC8 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
A6NLC8 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
A6NLC8 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
A6NLC8 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
A6NLC8 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
A6NLC8 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
A6NLC8 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
A6NLC8 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
A6NLC8 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
A6NLC8 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
A6NLC8 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
A6NLC8 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
A6NLC8 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
A6NLC8 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
A6NLC8 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
A6NLC8 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
A6NLC8 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
A6NLC8 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
A6NLC8 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
A6NLC8 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
A6NLC8 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
A6NLC8 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
A6NLC8 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
A6NLC8 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
A6NLC8 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
A6NLC8 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
A6NLC8 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
A6NLC8 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
A6NLC8 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
A6NLC8 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
A6NLC8 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
A6NLC8 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
A6NLC8 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
A6NLC8 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
A6NLC8 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
A6NLC8 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
A6NLC8 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
A6NLC8 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
A6NLC8 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
A6NLC8 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
A6NLC8 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
A6NLC8 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
A6NLC8 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
A6NLC8 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
A6NLC8 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
A6NLC8 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
A6NLC8 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
A6NLC8 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
A6NLC8 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
A6NLC8 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
A6NLC8 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
A6NLC8 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
A6NLC8 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
A6NLC8 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
A6NLC8 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
A6NLC8 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
A6NLC8 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
A6NLC8 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
A6NLC8 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
A6NLC8 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
A6NLC8 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
A6NLC8 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
A6NLC8 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
A6NLC8 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
A6NLC8 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
A6NLC8 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
A6NLC8 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
A6NLC8 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
A6NLC8 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
A6NLC8 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
A6NLC8 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
A6NLC8 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
A6NLC8 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
A6NLC8 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
A6NLC8 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
A6NLC8 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
A6NLC8 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms