Protein–RNA interactions for Protein: A6NFT4

CFAP73, Cilia- and flagella-associated protein 73, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP73A6NFT4 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CFAP73A6NFT4 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CFAP73A6NFT4 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CFAP73A6NFT4 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
CFAP73A6NFT4 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CFAP73A6NFT4 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CFAP73A6NFT4 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CFAP73A6NFT4 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CFAP73A6NFT4 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CFAP73A6NFT4 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CFAP73A6NFT4 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CFAP73A6NFT4 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CFAP73A6NFT4 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
CFAP73A6NFT4 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CFAP73A6NFT4 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CFAP73A6NFT4 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CFAP73A6NFT4 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CFAP73A6NFT4 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CFAP73A6NFT4 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CFAP73A6NFT4 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CFAP73A6NFT4 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CFAP73A6NFT4 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CFAP73A6NFT4 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CFAP73A6NFT4 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CFAP73A6NFT4 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CFAP73A6NFT4 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CFAP73A6NFT4 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CFAP73A6NFT4 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CFAP73A6NFT4 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CFAP73A6NFT4 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CFAP73A6NFT4 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CFAP73A6NFT4 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CFAP73A6NFT4 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CFAP73A6NFT4 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CFAP73A6NFT4 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CFAP73A6NFT4 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CFAP73A6NFT4 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CFAP73A6NFT4 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CFAP73A6NFT4 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CFAP73A6NFT4 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CFAP73A6NFT4 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CFAP73A6NFT4 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CFAP73A6NFT4 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CFAP73A6NFT4 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CFAP73A6NFT4 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CFAP73A6NFT4 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CFAP73A6NFT4 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CFAP73A6NFT4 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CFAP73A6NFT4 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CFAP73A6NFT4 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CFAP73A6NFT4 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
CFAP73A6NFT4 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CFAP73A6NFT4 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CFAP73A6NFT4 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CFAP73A6NFT4 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
CFAP73A6NFT4 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
CFAP73A6NFT4 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CFAP73A6NFT4 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CFAP73A6NFT4 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CFAP73A6NFT4 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CFAP73A6NFT4 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CFAP73A6NFT4 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CFAP73A6NFT4 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CFAP73A6NFT4 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CFAP73A6NFT4 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
CFAP73A6NFT4 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CFAP73A6NFT4 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CFAP73A6NFT4 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CFAP73A6NFT4 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CFAP73A6NFT4 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CFAP73A6NFT4 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CFAP73A6NFT4 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CFAP73A6NFT4 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CFAP73A6NFT4 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
CFAP73A6NFT4 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CFAP73A6NFT4 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CFAP73A6NFT4 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CFAP73A6NFT4 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CFAP73A6NFT4 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CFAP73A6NFT4 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CFAP73A6NFT4 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CFAP73A6NFT4 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CFAP73A6NFT4 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CFAP73A6NFT4 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CFAP73A6NFT4 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CFAP73A6NFT4 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CFAP73A6NFT4 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CFAP73A6NFT4 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CFAP73A6NFT4 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CFAP73A6NFT4 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CFAP73A6NFT4 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CFAP73A6NFT4 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CFAP73A6NFT4 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CFAP73A6NFT4 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CFAP73A6NFT4 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CFAP73A6NFT4 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CFAP73A6NFT4 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CFAP73A6NFT4 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
CFAP73A6NFT4 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CFAP73A6NFT4 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.4 ms