Protein–RNA interactions for Protein: A0A599

TCRBV5S2, T-cell receptor beta variable 5-6 (Fragment), humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCRBV5S2A0A599 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TCRBV5S2A0A599 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TCRBV5S2A0A599 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TCRBV5S2A0A599 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TCRBV5S2A0A599 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TCRBV5S2A0A599 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
TCRBV5S2A0A599 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TCRBV5S2A0A599 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TCRBV5S2A0A599 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TCRBV5S2A0A599 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TCRBV5S2A0A599 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TCRBV5S2A0A599 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TCRBV5S2A0A599 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TCRBV5S2A0A599 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TCRBV5S2A0A599 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TCRBV5S2A0A599 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TCRBV5S2A0A599 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TCRBV5S2A0A599 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TCRBV5S2A0A599 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TCRBV5S2A0A599 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TCRBV5S2A0A599 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TCRBV5S2A0A599 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TCRBV5S2A0A599 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TCRBV5S2A0A599 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TCRBV5S2A0A599 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
TCRBV5S2A0A599 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TCRBV5S2A0A599 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TCRBV5S2A0A599 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TCRBV5S2A0A599 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TCRBV5S2A0A599 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TCRBV5S2A0A599 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TCRBV5S2A0A599 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TCRBV5S2A0A599 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TCRBV5S2A0A599 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TCRBV5S2A0A599 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TCRBV5S2A0A599 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TCRBV5S2A0A599 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TCRBV5S2A0A599 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TCRBV5S2A0A599 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TCRBV5S2A0A599 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TCRBV5S2A0A599 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TCRBV5S2A0A599 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TCRBV5S2A0A599 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TCRBV5S2A0A599 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TCRBV5S2A0A599 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TCRBV5S2A0A599 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TCRBV5S2A0A599 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TCRBV5S2A0A599 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TCRBV5S2A0A599 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TCRBV5S2A0A599 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TCRBV5S2A0A599 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TCRBV5S2A0A599 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TCRBV5S2A0A599 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TCRBV5S2A0A599 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TCRBV5S2A0A599 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TCRBV5S2A0A599 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TCRBV5S2A0A599 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TCRBV5S2A0A599 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TCRBV5S2A0A599 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TCRBV5S2A0A599 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TCRBV5S2A0A599 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TCRBV5S2A0A599 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TCRBV5S2A0A599 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TCRBV5S2A0A599 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
TCRBV5S2A0A599 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.51
TCRBV5S2A0A599 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TCRBV5S2A0A599 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TCRBV5S2A0A599 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
TCRBV5S2A0A599 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TCRBV5S2A0A599 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TCRBV5S2A0A599 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TCRBV5S2A0A599 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TCRBV5S2A0A599 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TCRBV5S2A0A599 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TCRBV5S2A0A599 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TCRBV5S2A0A599 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TCRBV5S2A0A599 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
TCRBV5S2A0A599 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
TCRBV5S2A0A599 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TCRBV5S2A0A599 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TCRBV5S2A0A599 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TCRBV5S2A0A599 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TCRBV5S2A0A599 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TCRBV5S2A0A599 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TCRBV5S2A0A599 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TCRBV5S2A0A599 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TCRBV5S2A0A599 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TCRBV5S2A0A599 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TCRBV5S2A0A599 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TCRBV5S2A0A599 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TCRBV5S2A0A599 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TCRBV5S2A0A599 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
TCRBV5S2A0A599 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TCRBV5S2A0A599 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TCRBV5S2A0A599 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TCRBV5S2A0A599 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TCRBV5S2A0A599 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TCRBV5S2A0A599 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TCRBV5S2A0A599 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TCRBV5S2A0A599 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.48
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