Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RQW1

LOC100506127, Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LOC100506127A0A0U1RQW1 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
LOC100506127A0A0U1RQW1 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LOC100506127A0A0U1RQW1 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LOC100506127A0A0U1RQW1 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LOC100506127A0A0U1RQW1 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LOC100506127A0A0U1RQW1 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LOC100506127A0A0U1RQW1 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LOC100506127A0A0U1RQW1 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LOC100506127A0A0U1RQW1 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LOC100506127A0A0U1RQW1 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LOC100506127A0A0U1RQW1 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LOC100506127A0A0U1RQW1 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LOC100506127A0A0U1RQW1 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LOC100506127A0A0U1RQW1 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LOC100506127A0A0U1RQW1 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LOC100506127A0A0U1RQW1 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LOC100506127A0A0U1RQW1 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LOC100506127A0A0U1RQW1 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LOC100506127A0A0U1RQW1 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LOC100506127A0A0U1RQW1 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LOC100506127A0A0U1RQW1 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LOC100506127A0A0U1RQW1 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LOC100506127A0A0U1RQW1 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LOC100506127A0A0U1RQW1 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
LOC100506127A0A0U1RQW1 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LOC100506127A0A0U1RQW1 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LOC100506127A0A0U1RQW1 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LOC100506127A0A0U1RQW1 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LOC100506127A0A0U1RQW1 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LOC100506127A0A0U1RQW1 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LOC100506127A0A0U1RQW1 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
LOC100506127A0A0U1RQW1 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LOC100506127A0A0U1RQW1 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LOC100506127A0A0U1RQW1 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LOC100506127A0A0U1RQW1 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LOC100506127A0A0U1RQW1 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LOC100506127A0A0U1RQW1 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LOC100506127A0A0U1RQW1 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LOC100506127A0A0U1RQW1 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LOC100506127A0A0U1RQW1 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LOC100506127A0A0U1RQW1 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LOC100506127A0A0U1RQW1 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LOC100506127A0A0U1RQW1 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LOC100506127A0A0U1RQW1 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LOC100506127A0A0U1RQW1 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LOC100506127A0A0U1RQW1 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LOC100506127A0A0U1RQW1 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LOC100506127A0A0U1RQW1 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LOC100506127A0A0U1RQW1 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
LOC100506127A0A0U1RQW1 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
LOC100506127A0A0U1RQW1 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LOC100506127A0A0U1RQW1 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LOC100506127A0A0U1RQW1 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LOC100506127A0A0U1RQW1 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LOC100506127A0A0U1RQW1 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LOC100506127A0A0U1RQW1 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LOC100506127A0A0U1RQW1 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LOC100506127A0A0U1RQW1 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LOC100506127A0A0U1RQW1 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LOC100506127A0A0U1RQW1 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LOC100506127A0A0U1RQW1 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LOC100506127A0A0U1RQW1 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LOC100506127A0A0U1RQW1 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LOC100506127A0A0U1RQW1 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LOC100506127A0A0U1RQW1 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LOC100506127A0A0U1RQW1 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LOC100506127A0A0U1RQW1 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LOC100506127A0A0U1RQW1 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LOC100506127A0A0U1RQW1 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LOC100506127A0A0U1RQW1 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LOC100506127A0A0U1RQW1 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LOC100506127A0A0U1RQW1 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LOC100506127A0A0U1RQW1 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LOC100506127A0A0U1RQW1 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LOC100506127A0A0U1RQW1 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LOC100506127A0A0U1RQW1 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LOC100506127A0A0U1RQW1 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LOC100506127A0A0U1RQW1 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LOC100506127A0A0U1RQW1 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LOC100506127A0A0U1RQW1 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LOC100506127A0A0U1RQW1 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LOC100506127A0A0U1RQW1 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LOC100506127A0A0U1RQW1 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LOC100506127A0A0U1RQW1 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LOC100506127A0A0U1RQW1 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LOC100506127A0A0U1RQW1 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LOC100506127A0A0U1RQW1 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LOC100506127A0A0U1RQW1 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LOC100506127A0A0U1RQW1 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LOC100506127A0A0U1RQW1 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LOC100506127A0A0U1RQW1 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LOC100506127A0A0U1RQW1 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LOC100506127A0A0U1RQW1 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LOC100506127A0A0U1RQW1 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LOC100506127A0A0U1RQW1 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LOC100506127A0A0U1RQW1 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LOC100506127A0A0U1RQW1 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LOC100506127A0A0U1RQW1 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LOC100506127A0A0U1RQW1 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LOC100506127A0A0U1RQW1 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms