Protein–RNA interactions for Protein: A0A0C4DH30

IGHV3-16, Immunoglobulin heavy variable 3-16 (non-functional) (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHV3-16A0A0C4DH30 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
IGHV3-16A0A0C4DH30 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
IGHV3-16A0A0C4DH30 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
IGHV3-16A0A0C4DH30 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
IGHV3-16A0A0C4DH30 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
IGHV3-16A0A0C4DH30 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
IGHV3-16A0A0C4DH30 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
IGHV3-16A0A0C4DH30 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
IGHV3-16A0A0C4DH30 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
IGHV3-16A0A0C4DH30 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
IGHV3-16A0A0C4DH30 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
IGHV3-16A0A0C4DH30 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
IGHV3-16A0A0C4DH30 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
IGHV3-16A0A0C4DH30 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
IGHV3-16A0A0C4DH30 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
IGHV3-16A0A0C4DH30 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
IGHV3-16A0A0C4DH30 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
IGHV3-16A0A0C4DH30 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
IGHV3-16A0A0C4DH30 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
IGHV3-16A0A0C4DH30 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
IGHV3-16A0A0C4DH30 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
IGHV3-16A0A0C4DH30 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
IGHV3-16A0A0C4DH30 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
IGHV3-16A0A0C4DH30 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
IGHV3-16A0A0C4DH30 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
IGHV3-16A0A0C4DH30 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.65
IGHV3-16A0A0C4DH30 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
IGHV3-16A0A0C4DH30 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
IGHV3-16A0A0C4DH30 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
IGHV3-16A0A0C4DH30 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
IGHV3-16A0A0C4DH30 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
IGHV3-16A0A0C4DH30 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
IGHV3-16A0A0C4DH30 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
IGHV3-16A0A0C4DH30 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
IGHV3-16A0A0C4DH30 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
IGHV3-16A0A0C4DH30 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
IGHV3-16A0A0C4DH30 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
IGHV3-16A0A0C4DH30 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
IGHV3-16A0A0C4DH30 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
IGHV3-16A0A0C4DH30 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
IGHV3-16A0A0C4DH30 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
IGHV3-16A0A0C4DH30 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
IGHV3-16A0A0C4DH30 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
IGHV3-16A0A0C4DH30 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
IGHV3-16A0A0C4DH30 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
IGHV3-16A0A0C4DH30 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
IGHV3-16A0A0C4DH30 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
IGHV3-16A0A0C4DH30 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
IGHV3-16A0A0C4DH30 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
IGHV3-16A0A0C4DH30 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
IGHV3-16A0A0C4DH30 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
IGHV3-16A0A0C4DH30 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
IGHV3-16A0A0C4DH30 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
IGHV3-16A0A0C4DH30 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
IGHV3-16A0A0C4DH30 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
IGHV3-16A0A0C4DH30 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
IGHV3-16A0A0C4DH30 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
IGHV3-16A0A0C4DH30 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
IGHV3-16A0A0C4DH30 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
IGHV3-16A0A0C4DH30 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
IGHV3-16A0A0C4DH30 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
IGHV3-16A0A0C4DH30 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
IGHV3-16A0A0C4DH30 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
IGHV3-16A0A0C4DH30 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
IGHV3-16A0A0C4DH30 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
IGHV3-16A0A0C4DH30 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
IGHV3-16A0A0C4DH30 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
IGHV3-16A0A0C4DH30 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
IGHV3-16A0A0C4DH30 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
IGHV3-16A0A0C4DH30 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
IGHV3-16A0A0C4DH30 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
IGHV3-16A0A0C4DH30 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
IGHV3-16A0A0C4DH30 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
IGHV3-16A0A0C4DH30 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
IGHV3-16A0A0C4DH30 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
IGHV3-16A0A0C4DH30 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
IGHV3-16A0A0C4DH30 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
IGHV3-16A0A0C4DH30 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
IGHV3-16A0A0C4DH30 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
IGHV3-16A0A0C4DH30 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
IGHV3-16A0A0C4DH30 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
IGHV3-16A0A0C4DH30 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
IGHV3-16A0A0C4DH30 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
IGHV3-16A0A0C4DH30 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
IGHV3-16A0A0C4DH30 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
IGHV3-16A0A0C4DH30 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
IGHV3-16A0A0C4DH30 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
IGHV3-16A0A0C4DH30 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
IGHV3-16A0A0C4DH30 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
IGHV3-16A0A0C4DH30 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
IGHV3-16A0A0C4DH30 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
IGHV3-16A0A0C4DH30 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
IGHV3-16A0A0C4DH30 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
IGHV3-16A0A0C4DH30 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
IGHV3-16A0A0C4DH30 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
IGHV3-16A0A0C4DH30 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
IGHV3-16A0A0C4DH30 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
IGHV3-16A0A0C4DH30 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
IGHV3-16A0A0C4DH30 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
IGHV3-16A0A0C4DH30 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.8 ms