Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J203

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 849 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0B4J203 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
A0A0B4J203 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
A0A0B4J203 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
A0A0B4J203 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
A0A0B4J203 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
A0A0B4J203 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
A0A0B4J203 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
A0A0B4J203 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
A0A0B4J203 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
A0A0B4J203 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
A0A0B4J203 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
A0A0B4J203 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
A0A0B4J203 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
A0A0B4J203 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
A0A0B4J203 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
A0A0B4J203 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
A0A0B4J203 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
A0A0B4J203 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
A0A0B4J203 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
A0A0B4J203 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
A0A0B4J203 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
A0A0B4J203 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
A0A0B4J203 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
A0A0B4J203 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
A0A0B4J203 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
A0A0B4J203 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
A0A0B4J203 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
A0A0B4J203 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
A0A0B4J203 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
A0A0B4J203 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
A0A0B4J203 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
A0A0B4J203 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
A0A0B4J203 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
A0A0B4J203 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
A0A0B4J203 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
A0A0B4J203 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
A0A0B4J203 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
A0A0B4J203 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
A0A0B4J203 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
A0A0B4J203 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
A0A0B4J203 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
A0A0B4J203 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
A0A0B4J203 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
A0A0B4J203 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
A0A0B4J203 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
A0A0B4J203 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
A0A0B4J203 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
A0A0B4J203 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
A0A0B4J203 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
A0A0B4J203 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
A0A0B4J203 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
A0A0B4J203 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
A0A0B4J203 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
A0A0B4J203 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
A0A0B4J203 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
A0A0B4J203 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
A0A0B4J203 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
A0A0B4J203 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
A0A0B4J203 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
A0A0B4J203 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
A0A0B4J203 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
A0A0B4J203 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
A0A0B4J203 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
A0A0B4J203 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
A0A0B4J203 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
A0A0B4J203 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
A0A0B4J203 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
A0A0B4J203 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
A0A0B4J203 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
A0A0B4J203 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
A0A0B4J203 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
A0A0B4J203 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
A0A0B4J203 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
A0A0B4J203 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
A0A0B4J203 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
A0A0B4J203 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
A0A0B4J203 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
A0A0B4J203 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
A0A0B4J203 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
A0A0B4J203 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
A0A0B4J203 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
A0A0B4J203 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
A0A0B4J203 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
A0A0B4J203 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
A0A0B4J203 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
A0A0B4J203 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
A0A0B4J203 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
A0A0B4J203 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
A0A0B4J203 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
A0A0B4J203 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
A0A0B4J203 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
A0A0B4J203 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
A0A0B4J203 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
A0A0B4J203 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
A0A0B4J203 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
A0A0B4J203 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
A0A0B4J203 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
A0A0B4J203 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
A0A0B4J203 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
A0A0B4J203 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms