Protein–RNA interactions for Protein: A0A0A0MS03

TRBV5-3, T-cell receptor beta variable 5-3 (non-functional) (Fragment), humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV5-3A0A0A0MS03 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRBV5-3A0A0A0MS03 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRBV5-3A0A0A0MS03 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRBV5-3A0A0A0MS03 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRBV5-3A0A0A0MS03 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRBV5-3A0A0A0MS03 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRBV5-3A0A0A0MS03 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
TRBV5-3A0A0A0MS03 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRBV5-3A0A0A0MS03 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRBV5-3A0A0A0MS03 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRBV5-3A0A0A0MS03 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRBV5-3A0A0A0MS03 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
TRBV5-3A0A0A0MS03 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRBV5-3A0A0A0MS03 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRBV5-3A0A0A0MS03 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRBV5-3A0A0A0MS03 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRBV5-3A0A0A0MS03 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRBV5-3A0A0A0MS03 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRBV5-3A0A0A0MS03 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRBV5-3A0A0A0MS03 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRBV5-3A0A0A0MS03 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRBV5-3A0A0A0MS03 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRBV5-3A0A0A0MS03 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRBV5-3A0A0A0MS03 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRBV5-3A0A0A0MS03 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRBV5-3A0A0A0MS03 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRBV5-3A0A0A0MS03 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRBV5-3A0A0A0MS03 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRBV5-3A0A0A0MS03 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRBV5-3A0A0A0MS03 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRBV5-3A0A0A0MS03 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRBV5-3A0A0A0MS03 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRBV5-3A0A0A0MS03 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRBV5-3A0A0A0MS03 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRBV5-3A0A0A0MS03 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRBV5-3A0A0A0MS03 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRBV5-3A0A0A0MS03 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRBV5-3A0A0A0MS03 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRBV5-3A0A0A0MS03 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRBV5-3A0A0A0MS03 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRBV5-3A0A0A0MS03 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRBV5-3A0A0A0MS03 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRBV5-3A0A0A0MS03 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRBV5-3A0A0A0MS03 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRBV5-3A0A0A0MS03 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRBV5-3A0A0A0MS03 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRBV5-3A0A0A0MS03 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRBV5-3A0A0A0MS03 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRBV5-3A0A0A0MS03 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRBV5-3A0A0A0MS03 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRBV5-3A0A0A0MS03 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRBV5-3A0A0A0MS03 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRBV5-3A0A0A0MS03 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRBV5-3A0A0A0MS03 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRBV5-3A0A0A0MS03 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRBV5-3A0A0A0MS03 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRBV5-3A0A0A0MS03 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TRBV5-3A0A0A0MS03 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRBV5-3A0A0A0MS03 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRBV5-3A0A0A0MS03 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRBV5-3A0A0A0MS03 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRBV5-3A0A0A0MS03 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRBV5-3A0A0A0MS03 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRBV5-3A0A0A0MS03 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRBV5-3A0A0A0MS03 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRBV5-3A0A0A0MS03 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRBV5-3A0A0A0MS03 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRBV5-3A0A0A0MS03 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRBV5-3A0A0A0MS03 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRBV5-3A0A0A0MS03 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRBV5-3A0A0A0MS03 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRBV5-3A0A0A0MS03 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRBV5-3A0A0A0MS03 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRBV5-3A0A0A0MS03 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRBV5-3A0A0A0MS03 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRBV5-3A0A0A0MS03 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRBV5-3A0A0A0MS03 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRBV5-3A0A0A0MS03 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRBV5-3A0A0A0MS03 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRBV5-3A0A0A0MS03 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRBV5-3A0A0A0MS03 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRBV5-3A0A0A0MS03 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRBV5-3A0A0A0MS03 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRBV5-3A0A0A0MS03 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRBV5-3A0A0A0MS03 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRBV5-3A0A0A0MS03 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRBV5-3A0A0A0MS03 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRBV5-3A0A0A0MS03 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRBV5-3A0A0A0MS03 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRBV5-3A0A0A0MS03 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRBV5-3A0A0A0MS03 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
TRBV5-3A0A0A0MS03 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRBV5-3A0A0A0MS03 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRBV5-3A0A0A0MS03 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRBV5-3A0A0A0MS03 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRBV5-3A0A0A0MS03 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRBV5-3A0A0A0MS03 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRBV5-3A0A0A0MS03 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
TRBV5-3A0A0A0MS03 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRBV5-3A0A0A0MS03 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
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