Protein–RNA interactions for Protein: Q16665

HIF1A, Hypoxia-inducible factor 1-alpha, humanhuman

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Length 826 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIF1AQ16665 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
HIF1AQ16665 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
HIF1AQ16665 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
HIF1AQ16665 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
HIF1AQ16665 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
HIF1AQ16665 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
HIF1AQ16665 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
HIF1AQ16665 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
HIF1AQ16665 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
HIF1AQ16665 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
HIF1AQ16665 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
HIF1AQ16665 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
HIF1AQ16665 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
HIF1AQ16665 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
HIF1AQ16665 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
HIF1AQ16665 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
HIF1AQ16665 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
HIF1AQ16665 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
HIF1AQ16665 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
HIF1AQ16665 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
HIF1AQ16665 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
HIF1AQ16665 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
HIF1AQ16665 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
HIF1AQ16665 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
HIF1AQ16665 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
HIF1AQ16665 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
HIF1AQ16665 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
HIF1AQ16665 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
HIF1AQ16665 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
HIF1AQ16665 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
HIF1AQ16665 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
HIF1AQ16665 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
HIF1AQ16665 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
HIF1AQ16665 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
HIF1AQ16665 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
HIF1AQ16665 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
HIF1AQ16665 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
HIF1AQ16665 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
HIF1AQ16665 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
HIF1AQ16665 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
HIF1AQ16665 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
HIF1AQ16665 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
HIF1AQ16665 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
HIF1AQ16665 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
HIF1AQ16665 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
HIF1AQ16665 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
HIF1AQ16665 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
HIF1AQ16665 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
HIF1AQ16665 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
HIF1AQ16665 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
HIF1AQ16665 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
HIF1AQ16665 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
HIF1AQ16665 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
HIF1AQ16665 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
HIF1AQ16665 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
HIF1AQ16665 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
HIF1AQ16665 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
HIF1AQ16665 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
HIF1AQ16665 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
HIF1AQ16665 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
HIF1AQ16665 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
HIF1AQ16665 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
HIF1AQ16665 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
HIF1AQ16665 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
HIF1AQ16665 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
HIF1AQ16665 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
HIF1AQ16665 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
HIF1AQ16665 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
HIF1AQ16665 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
HIF1AQ16665 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
HIF1AQ16665 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
HIF1AQ16665 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
HIF1AQ16665 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
HIF1AQ16665 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
HIF1AQ16665 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
HIF1AQ16665 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
HIF1AQ16665 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
HIF1AQ16665 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
HIF1AQ16665 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
HIF1AQ16665 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
HIF1AQ16665 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
HIF1AQ16665 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
HIF1AQ16665 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
HIF1AQ16665 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
HIF1AQ16665 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
HIF1AQ16665 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
HIF1AQ16665 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
HIF1AQ16665 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
HIF1AQ16665 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
HIF1AQ16665 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
HIF1AQ16665 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
HIF1AQ16665 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
HIF1AQ16665 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
HIF1AQ16665 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
HIF1AQ16665 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
HIF1AQ16665 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
HIF1AQ16665 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
HIF1AQ16665 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
HIF1AQ16665 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
HIF1AQ16665 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
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