Protein–RNA interactions for Protein: P40509

SEC28, Coatomer subunit epsilon, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 296 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SEC28P40509 RTT107YHR154W 3213 nt2.22□□□□□ -2.05
SEC28P40509 VPH1YOR270C 2523 nt2.22□□□□□ -2.05
SEC28P40509 AAD16YFL057C 459 nt2.22□□□□□ -2.05
SEC28P40509 YJL052C-AYJL052C-A 120 nt2.22□□□□□ -2.05
SEC28P40509 TRS20YBR254C 528 nt2.22□□□□□ -2.05
SEC28P40509 VMA9YCL005W-A 222 nt2.22□□□□□ -2.05
SEC28P40509 MMS22YLR320W 4365 nt2.21□□□□□ -2.05
SEC28P40509 RUD3YOR216C 1455 nt2.21□□□□□ -2.06
SEC28P40509 SAP185YJL098W 3177 nt2.21□□□□□ -2.06
SEC28P40509 NCL1YBL024W 2055 nt2.21□□□□□ -2.06
SEC28P40509 NIC96YFR002W 2520 nt2.21□□□□□ -2.06
SEC28P40509 RTT101YJL047C 2529 nt2.21□□□□□ -2.06
SEC28P40509 snR9snR9 187 nt2.21□□□□□ -2.06
SEC28P40509 YDR461C-AYDR461C-A 243 nt2.21□□□□□ -2.06
SEC28P40509 MSL1YIR009W 336 nt2.21□□□□□ -2.06
SEC28P40509 IRC8YJL051W 2469 nt2.21□□□□□ -2.06
SEC28P40509 CSE4YKL049C 690 nt2.21□□□□□ -2.06
SEC28P40509 YOL029CYOL029C 606 nt2.21□□□□□ -2.06
SEC28P40509 ARF3YOR094W 552 nt2.21□□□□□ -2.06
SEC28P40509 CDC53YDL132W 2448 nt2.21□□□□□ -2.06
SEC28P40509 NAN1YPL126W 2691 nt2.21□□□□□ -2.06
SEC28P40509 YFL012WYFL012W 447 nt2.2□□□□□ -2.06
SEC28P40509 YGL014C-AYGL014C-A 162 nt2.2□□□□□ -2.06
SEC28P40509 RPL40AYIL148W 387 nt2.2□□□□□ -2.06
SEC28P40509 PSY1YKL076C 384 nt2.2□□□□□ -2.06
SEC28P40509 YAL059C-AYAL059C-A 423 nt2.2□□□□□ -2.06
SEC28P40509 RRI2YOL117W 1938 nt2.2□□□□□ -2.06
SEC28P40509 UTP22YGR090W 3714 nt2.19□□□□□ -2.06
SEC28P40509 COS111YBR203W 2775 nt2.19□□□□□ -2.06
SEC28P40509 CDC50YCR094W 1176 nt2.19□□□□□ -2.06
SEC28P40509 UBC5YDR059C 447 nt2.19□□□□□ -2.06
SEC28P40509 YGR228WYGR228W 345 nt2.19□□□□□ -2.06
SEC28P40509 CSM4YPL200W 471 nt2.19□□□□□ -2.06
SEC28P40509 IPT1YDR072C 1584 nt2.19□□□□□ -2.06
SEC28P40509 DNF1YER166W 4716 nt2.19□□□□□ -2.06
SEC28P40509 NAB6YML117W 3405 nt2.18□□□□□ -2.06
SEC28P40509 TMA20YER007C-A 546 nt2.18□□□□□ -2.06
SEC28P40509 YBL029C-AYBL029C-A 285 nt2.18□□□□□ -2.06
SEC28P40509 TOA1YOR194C 861 nt2.18□□□□□ -2.06
SEC28P40509 YOR283WYOR283W 693 nt2.18□□□□□ -2.06
SEC28P40509 DGK1YOR311C 873 nt2.18□□□□□ -2.06
SEC28P40509 YPL080CYPL080C 327 nt2.18□□□□□ -2.06
SEC28P40509 YCL007CYCL007C 393 nt2.18□□□□□ -2.06
SEC28P40509 BRE1YDL074C 2103 nt2.18□□□□□ -2.06
SEC28P40509 BRO1YPL084W 2535 nt2.18□□□□□ -2.06
SEC28P40509 TRL1YJL087C 2484 nt2.17□□□□□ -2.06
SEC28P40509 YDL025W-AYDL025W-A 105 nt2.17□□□□□ -2.06
SEC28P40509 TPM2YIL138C 486 nt2.17□□□□□ -2.06
SEC28P40509 PEP8YJL053W 1140 nt2.17□□□□□ -2.06
SEC28P40509 SNC1YAL030W 354 nt2.17□□□□□ -2.06
SEC28P40509 ARV1YLR242C 966 nt2.17□□□□□ -2.06
SEC28P40509 YMR304C-AYMR304C-A 351 nt2.17□□□□□ -2.06
SEC28P40509 LSM7YNL147W 348 nt2.17□□□□□ -2.06
SEC28P40509 YOR333CYOR333C 417 nt2.17□□□□□ -2.06
SEC28P40509 ELG1YOR144C 2376 nt2.17□□□□□ -2.06
SEC28P40509 GCN4YEL009C 846 nt2.16□□□□□ -2.06
SEC28P40509 VTC1YER072W 390 nt2.16□□□□□ -2.06
SEC28P40509 SNO3YFL060C 669 nt2.16□□□□□ -2.06
SEC28P40509 AYR1YIL124W 894 nt2.16□□□□□ -2.06
SEC28P40509 PRP21YJL203W 843 nt2.16□□□□□ -2.06
SEC28P40509 SNO2YNL334C 669 nt2.16□□□□□ -2.06
SEC28P40509 MSS18YPR134W 807 nt2.16□□□□□ -2.06
SEC28P40509 MUD1YBR119W 897 nt2.16□□□□□ -2.06
SEC28P40509 VPS8YAL002W 3825 nt2.16□□□□□ -2.06
SEC28P40509 YER038W-AYER038W-A 381 nt2.15□□□□□ -2.07
SEC28P40509 YFR009W-AYFR009W-A 258 nt2.15□□□□□ -2.07
SEC28P40509 RCN1YKL159C 636 nt2.15□□□□□ -2.07
SEC28P40509 YMR254CYMR254C 309 nt2.15□□□□□ -2.07
SEC28P40509 MNE1YOR350C 1992 nt2.15□□□□□ -2.07
SEC28P40509 BUD2YKL092C 3315 nt2.14□□□□□ -2.07
SEC28P40509 MCD1YDL003W 1701 nt2.14□□□□□ -2.07
SEC28P40509 MPH1YIR002C 2982 nt2.14□□□□□ -2.07
SEC28P40509 RRF1YHR038W 693 nt2.14□□□□□ -2.07
SEC28P40509 NOP10YHR072W-A 177 nt2.14□□□□□ -2.07
SEC28P40509 LCL2YLR104W 396 nt2.14□□□□□ -2.07
SEC28P40509 RPS22BYLR367W 393 nt2.14□□□□□ -2.07
SEC28P40509 CCW14YLR390W-A 717 nt2.14□□□□□ -2.07
SEC28P40509 YOR105WYOR105W 327 nt2.14□□□□□ -2.07
SEC28P40509 FKS1YLR342W 5631 nt2.14□□□□□ -2.07
SEC28P40509 KAP123YER110C 3342 nt2.14□□□□□ -2.07
SEC28P40509 ALK2YBL009W 2031 nt2.13□□□□□ -2.07
SEC28P40509 YDR018CYDR018C 1191 nt2.13□□□□□ -2.07
SEC28P40509 YKR075W-AYKR075W-A 270 nt2.13□□□□□ -2.07
SEC28P40509 DGR1YNL130C-A 147 nt2.13□□□□□ -2.07
SEC28P40509 FAB1YFR019W 6837 nt2.13□□□□□ -2.07
SEC28P40509 DPB11YJL090C 2295 nt2.13□□□□□ -2.07
SEC28P40509 KOG1YHR186C 4674 nt2.13□□□□□ -2.07
SEC28P40509 TOR2YKL203C 7425 nt2.13□□□□□ -2.07
SEC28P40509 CDC60YPL160W 3273 nt2.13□□□□□ -2.07
SEC28P40509 USO1YDL058W 5373 nt2.12□□□□□ -2.07
SEC28P40509 ATG9YDL149W 2994 nt2.12□□□□□ -2.07
SEC28P40509 SPE1YKL184W 1401 nt2.12□□□□□ -2.07
SEC28P40509 CRD1YDL142C 852 nt2.12□□□□□ -2.07
SEC28P40509 RPL27BYDR471W 411 nt2.12□□□□□ -2.07
SEC28P40509 IRC4YDR540C 540 nt2.12□□□□□ -2.07
SEC28P40509 YJR087WYJR087W 351 nt2.12□□□□□ -2.07
SEC28P40509 CMS1YLR003C 876 nt2.12□□□□□ -2.07
SEC28P40509 YHC1YLR298C 696 nt2.12□□□□□ -2.07
SEC28P40509 RPB5YBR154C 648 nt2.12□□□□□ -2.07
SEC28P40509 REF2YDR195W 1602 nt2.12□□□□□ -2.07
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