Protein–RNA interactions for Protein: Q96BD5

PHF21A, PHD finger protein 21A, humanhuman

Predictions only

Length 680 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF21AQ96BD5 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PHF21AQ96BD5 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PHF21AQ96BD5 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PHF21AQ96BD5 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PHF21AQ96BD5 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
PHF21AQ96BD5 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PHF21AQ96BD5 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PHF21AQ96BD5 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PHF21AQ96BD5 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PHF21AQ96BD5 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PHF21AQ96BD5 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PHF21AQ96BD5 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PHF21AQ96BD5 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PHF21AQ96BD5 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
PHF21AQ96BD5 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PHF21AQ96BD5 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
PHF21AQ96BD5 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PHF21AQ96BD5 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PHF21AQ96BD5 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PHF21AQ96BD5 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PHF21AQ96BD5 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PHF21AQ96BD5 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PHF21AQ96BD5 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PHF21AQ96BD5 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PHF21AQ96BD5 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PHF21AQ96BD5 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PHF21AQ96BD5 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PHF21AQ96BD5 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PHF21AQ96BD5 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PHF21AQ96BD5 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PHF21AQ96BD5 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PHF21AQ96BD5 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PHF21AQ96BD5 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PHF21AQ96BD5 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PHF21AQ96BD5 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PHF21AQ96BD5 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PHF21AQ96BD5 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PHF21AQ96BD5 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PHF21AQ96BD5 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PHF21AQ96BD5 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PHF21AQ96BD5 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PHF21AQ96BD5 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PHF21AQ96BD5 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PHF21AQ96BD5 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PHF21AQ96BD5 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PHF21AQ96BD5 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PHF21AQ96BD5 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PHF21AQ96BD5 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PHF21AQ96BD5 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PHF21AQ96BD5 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PHF21AQ96BD5 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PHF21AQ96BD5 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PHF21AQ96BD5 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PHF21AQ96BD5 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PHF21AQ96BD5 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PHF21AQ96BD5 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PHF21AQ96BD5 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PHF21AQ96BD5 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PHF21AQ96BD5 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PHF21AQ96BD5 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PHF21AQ96BD5 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PHF21AQ96BD5 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PHF21AQ96BD5 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PHF21AQ96BD5 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PHF21AQ96BD5 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PHF21AQ96BD5 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PHF21AQ96BD5 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PHF21AQ96BD5 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PHF21AQ96BD5 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PHF21AQ96BD5 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PHF21AQ96BD5 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PHF21AQ96BD5 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PHF21AQ96BD5 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PHF21AQ96BD5 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
PHF21AQ96BD5 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PHF21AQ96BD5 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PHF21AQ96BD5 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PHF21AQ96BD5 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PHF21AQ96BD5 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PHF21AQ96BD5 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PHF21AQ96BD5 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PHF21AQ96BD5 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PHF21AQ96BD5 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PHF21AQ96BD5 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PHF21AQ96BD5 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PHF21AQ96BD5 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PHF21AQ96BD5 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PHF21AQ96BD5 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PHF21AQ96BD5 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PHF21AQ96BD5 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PHF21AQ96BD5 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PHF21AQ96BD5 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
PHF21AQ96BD5 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PHF21AQ96BD5 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PHF21AQ96BD5 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PHF21AQ96BD5 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PHF21AQ96BD5 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PHF21AQ96BD5 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PHF21AQ96BD5 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PHF21AQ96BD5 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms