Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0B6

CCDC167, Coiled-coil domain-containing protein 167, humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC167Q9P0B6 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CCDC167Q9P0B6 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CCDC167Q9P0B6 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CCDC167Q9P0B6 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CCDC167Q9P0B6 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CCDC167Q9P0B6 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CCDC167Q9P0B6 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CCDC167Q9P0B6 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CCDC167Q9P0B6 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CCDC167Q9P0B6 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CCDC167Q9P0B6 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CCDC167Q9P0B6 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CCDC167Q9P0B6 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CCDC167Q9P0B6 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CCDC167Q9P0B6 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CCDC167Q9P0B6 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CCDC167Q9P0B6 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CCDC167Q9P0B6 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CCDC167Q9P0B6 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CCDC167Q9P0B6 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CCDC167Q9P0B6 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CCDC167Q9P0B6 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CCDC167Q9P0B6 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CCDC167Q9P0B6 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CCDC167Q9P0B6 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CCDC167Q9P0B6 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CCDC167Q9P0B6 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CCDC167Q9P0B6 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CCDC167Q9P0B6 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CCDC167Q9P0B6 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CCDC167Q9P0B6 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CCDC167Q9P0B6 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CCDC167Q9P0B6 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CCDC167Q9P0B6 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CCDC167Q9P0B6 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CCDC167Q9P0B6 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CCDC167Q9P0B6 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CCDC167Q9P0B6 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CCDC167Q9P0B6 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CCDC167Q9P0B6 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CCDC167Q9P0B6 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CCDC167Q9P0B6 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CCDC167Q9P0B6 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CCDC167Q9P0B6 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CCDC167Q9P0B6 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CCDC167Q9P0B6 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CCDC167Q9P0B6 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CCDC167Q9P0B6 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CCDC167Q9P0B6 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CCDC167Q9P0B6 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CCDC167Q9P0B6 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CCDC167Q9P0B6 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CCDC167Q9P0B6 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CCDC167Q9P0B6 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CCDC167Q9P0B6 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CCDC167Q9P0B6 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CCDC167Q9P0B6 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
CCDC167Q9P0B6 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CCDC167Q9P0B6 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CCDC167Q9P0B6 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
CCDC167Q9P0B6 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CCDC167Q9P0B6 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CCDC167Q9P0B6 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CCDC167Q9P0B6 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CCDC167Q9P0B6 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CCDC167Q9P0B6 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CCDC167Q9P0B6 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
CCDC167Q9P0B6 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
CCDC167Q9P0B6 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC19.77■□□□□ 0.75
CCDC167Q9P0B6 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
CCDC167Q9P0B6 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.75
CCDC167Q9P0B6 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CCDC167Q9P0B6 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CCDC167Q9P0B6 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CCDC167Q9P0B6 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CCDC167Q9P0B6 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CCDC167Q9P0B6 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CCDC167Q9P0B6 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CCDC167Q9P0B6 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CCDC167Q9P0B6 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CCDC167Q9P0B6 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CCDC167Q9P0B6 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CCDC167Q9P0B6 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CCDC167Q9P0B6 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
CCDC167Q9P0B6 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CCDC167Q9P0B6 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CCDC167Q9P0B6 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CCDC167Q9P0B6 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CCDC167Q9P0B6 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CCDC167Q9P0B6 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CCDC167Q9P0B6 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CCDC167Q9P0B6 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CCDC167Q9P0B6 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CCDC167Q9P0B6 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CCDC167Q9P0B6 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CCDC167Q9P0B6 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CCDC167Q9P0B6 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CCDC167Q9P0B6 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CCDC167Q9P0B6 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CCDC167Q9P0B6 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms