Protein–RNA interactions for Protein: Q86YR7

MCF2L2, Probable guanine nucleotide exchange factor MCF2L2, humanhuman

Predictions only

Length 1,114 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCF2L2Q86YR7 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
MCF2L2Q86YR7 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
MCF2L2Q86YR7 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MCF2L2Q86YR7 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MCF2L2Q86YR7 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MCF2L2Q86YR7 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MCF2L2Q86YR7 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MCF2L2Q86YR7 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MCF2L2Q86YR7 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MCF2L2Q86YR7 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MCF2L2Q86YR7 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MCF2L2Q86YR7 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MCF2L2Q86YR7 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MCF2L2Q86YR7 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MCF2L2Q86YR7 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
MCF2L2Q86YR7 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MCF2L2Q86YR7 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MCF2L2Q86YR7 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MCF2L2Q86YR7 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MCF2L2Q86YR7 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MCF2L2Q86YR7 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
MCF2L2Q86YR7 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.35
MCF2L2Q86YR7 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
MCF2L2Q86YR7 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
MCF2L2Q86YR7 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MCF2L2Q86YR7 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MCF2L2Q86YR7 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MCF2L2Q86YR7 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MCF2L2Q86YR7 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MCF2L2Q86YR7 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MCF2L2Q86YR7 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MCF2L2Q86YR7 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MCF2L2Q86YR7 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MCF2L2Q86YR7 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MCF2L2Q86YR7 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MCF2L2Q86YR7 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MCF2L2Q86YR7 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MCF2L2Q86YR7 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MCF2L2Q86YR7 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MCF2L2Q86YR7 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MCF2L2Q86YR7 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
MCF2L2Q86YR7 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MCF2L2Q86YR7 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MCF2L2Q86YR7 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MCF2L2Q86YR7 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MCF2L2Q86YR7 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MCF2L2Q86YR7 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MCF2L2Q86YR7 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MCF2L2Q86YR7 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MCF2L2Q86YR7 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MCF2L2Q86YR7 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MCF2L2Q86YR7 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MCF2L2Q86YR7 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MCF2L2Q86YR7 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MCF2L2Q86YR7 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MCF2L2Q86YR7 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MCF2L2Q86YR7 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MCF2L2Q86YR7 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MCF2L2Q86YR7 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MCF2L2Q86YR7 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MCF2L2Q86YR7 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MCF2L2Q86YR7 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MCF2L2Q86YR7 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MCF2L2Q86YR7 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MCF2L2Q86YR7 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MCF2L2Q86YR7 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MCF2L2Q86YR7 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MCF2L2Q86YR7 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MCF2L2Q86YR7 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MCF2L2Q86YR7 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MCF2L2Q86YR7 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MCF2L2Q86YR7 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MCF2L2Q86YR7 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MCF2L2Q86YR7 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MCF2L2Q86YR7 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MCF2L2Q86YR7 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MCF2L2Q86YR7 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MCF2L2Q86YR7 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MCF2L2Q86YR7 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
MCF2L2Q86YR7 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
MCF2L2Q86YR7 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
MCF2L2Q86YR7 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MCF2L2Q86YR7 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MCF2L2Q86YR7 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MCF2L2Q86YR7 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MCF2L2Q86YR7 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MCF2L2Q86YR7 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MCF2L2Q86YR7 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MCF2L2Q86YR7 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MCF2L2Q86YR7 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MCF2L2Q86YR7 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MCF2L2Q86YR7 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MCF2L2Q86YR7 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MCF2L2Q86YR7 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MCF2L2Q86YR7 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MCF2L2Q86YR7 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MCF2L2Q86YR7 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MCF2L2Q86YR7 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MCF2L2Q86YR7 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MCF2L2Q86YR7 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms