Protein–RNA interactions for Protein: Q3LHN0

KRTAP25-1, Keratin-associated protein 25-1, humanhuman

Predictions only

Length 102 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP25-1Q3LHN0 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
KRTAP25-1Q3LHN0 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
KRTAP25-1Q3LHN0 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
KRTAP25-1Q3LHN0 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC9.52□□□□□ -0.89
KRTAP25-1Q3LHN0 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
KRTAP25-1Q3LHN0 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
KRTAP25-1Q3LHN0 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
KRTAP25-1Q3LHN0 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
KRTAP25-1Q3LHN0 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
KRTAP25-1Q3LHN0 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC9.52□□□□□ -0.89
KRTAP25-1Q3LHN0 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
KRTAP25-1Q3LHN0 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
KRTAP25-1Q3LHN0 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
KRTAP25-1Q3LHN0 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
KRTAP25-1Q3LHN0 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
KRTAP25-1Q3LHN0 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
KRTAP25-1Q3LHN0 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
KRTAP25-1Q3LHN0 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC9.52□□□□□ -0.89
KRTAP25-1Q3LHN0 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
KRTAP25-1Q3LHN0 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
KRTAP25-1Q3LHN0 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
KRTAP25-1Q3LHN0 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
KRTAP25-1Q3LHN0 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
KRTAP25-1Q3LHN0 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
KRTAP25-1Q3LHN0 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
KRTAP25-1Q3LHN0 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
KRTAP25-1Q3LHN0 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
KRTAP25-1Q3LHN0 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
KRTAP25-1Q3LHN0 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
KRTAP25-1Q3LHN0 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
KRTAP25-1Q3LHN0 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
KRTAP25-1Q3LHN0 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
KRTAP25-1Q3LHN0 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
KRTAP25-1Q3LHN0 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
KRTAP25-1Q3LHN0 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
KRTAP25-1Q3LHN0 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
KRTAP25-1Q3LHN0 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
KRTAP25-1Q3LHN0 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
KRTAP25-1Q3LHN0 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
KRTAP25-1Q3LHN0 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC9.51□□□□□ -0.89
KRTAP25-1Q3LHN0 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
KRTAP25-1Q3LHN0 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
KRTAP25-1Q3LHN0 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
KRTAP25-1Q3LHN0 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
KRTAP25-1Q3LHN0 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
KRTAP25-1Q3LHN0 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
KRTAP25-1Q3LHN0 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
KRTAP25-1Q3LHN0 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
KRTAP25-1Q3LHN0 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
KRTAP25-1Q3LHN0 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
KRTAP25-1Q3LHN0 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
KRTAP25-1Q3LHN0 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
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KRTAP25-1Q3LHN0 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
KRTAP25-1Q3LHN0 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
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KRTAP25-1Q3LHN0 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
KRTAP25-1Q3LHN0 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
KRTAP25-1Q3LHN0 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
KRTAP25-1Q3LHN0 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
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KRTAP25-1Q3LHN0 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
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KRTAP25-1Q3LHN0 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
KRTAP25-1Q3LHN0 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
KRTAP25-1Q3LHN0 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
KRTAP25-1Q3LHN0 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
KRTAP25-1Q3LHN0 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
KRTAP25-1Q3LHN0 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
KRTAP25-1Q3LHN0 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
KRTAP25-1Q3LHN0 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
KRTAP25-1Q3LHN0 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
KRTAP25-1Q3LHN0 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
KRTAP25-1Q3LHN0 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
KRTAP25-1Q3LHN0 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
KRTAP25-1Q3LHN0 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
KRTAP25-1Q3LHN0 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
KRTAP25-1Q3LHN0 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
KRTAP25-1Q3LHN0 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
KRTAP25-1Q3LHN0 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
KRTAP25-1Q3LHN0 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
KRTAP25-1Q3LHN0 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
KRTAP25-1Q3LHN0 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
KRTAP25-1Q3LHN0 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
KRTAP25-1Q3LHN0 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
KRTAP25-1Q3LHN0 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
KRTAP25-1Q3LHN0 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
KRTAP25-1Q3LHN0 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
KRTAP25-1Q3LHN0 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
KRTAP25-1Q3LHN0 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
KRTAP25-1Q3LHN0 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
KRTAP25-1Q3LHN0 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
KRTAP25-1Q3LHN0 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
KRTAP25-1Q3LHN0 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
KRTAP25-1Q3LHN0 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
KRTAP25-1Q3LHN0 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
KRTAP25-1Q3LHN0 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
KRTAP25-1Q3LHN0 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
KRTAP25-1Q3LHN0 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
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