RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000357436.4

SH3BP1-201, Transcript of SH3 domain binding protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BP1, Length 2,852 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1-201ENST00000357436 NISCHQ9Y2I1 1504 aa39.98■■■■□ 3.99
SH3BP1-201ENST00000357436 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa34.11■■■■□ 3.05
SH3BP1-201ENST00000357436 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa34.01■■■■□ 3.03
SH3BP1-201ENST00000357436 DCAF8L2P0C7V8 631 aa33.97■■■■□ 3.03
SH3BP1-201ENST00000357436 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP33.61■■■□□ 2.97
SH3BP1-201ENST00000357436 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP32.95■■■□□ 2.86
SH3BP1-201ENST00000357436 ABCC9O60706 1549 aa32.83■■■□□ 2.85
SH3BP1-201ENST00000357436 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa32.55■■■□□ 2.8
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SH3BP1-201ENST00000357436 MYO15BQ96JP2 1530 aa31.86■■■□□ 2.69
SH3BP1-201ENST00000357436 NACADO15069 1562 aa31.83■■■□□ 2.69
SH3BP1-201ENST00000357436 CHIC1Q5VXU3 224 aa31.65■■■□□ 2.66
SH3BP1-201ENST00000357436 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa31.55■■■□□ 2.64
SH3BP1-201ENST00000357436 CECR2Q9BXF3 1484 aa31.45■■■□□ 2.63
SH3BP1-201ENST00000357436 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP31.43■■■□□ 2.62
SH3BP1-201ENST00000357436 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP31.39■■■□□ 2.62
SH3BP1-201ENST00000357436 MROH2BQ7Z745 1585 aa31.17■■■□□ 2.58
SH3BP1-201ENST00000357436 UNC13AQ9UPW8 1703 aa31.07■■■□□ 2.57
SH3BP1-201ENST00000357436 WIZO95785 1651 aa30.94■■■□□ 2.54
SH3BP1-201ENST00000357436 BICRAQ9NZM4 1560 aa30.8■■■□□ 2.52
SH3BP1-201ENST00000357436 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP30.71■■■□□ 2.51
SH3BP1-201ENST00000357436 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa30.67■■■□□ 2.5
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SH3BP1-201ENST00000357436 HRCP23327 699 aa30.57■■■□□ 2.48
SH3BP1-201ENST00000357436 TRIM41Q8WV44 630 aa30.57■■■□□ 2.48
SH3BP1-201ENST00000357436 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP30.56■■■□□ 2.48
SH3BP1-201ENST00000357436 EHMT2Q96KQ7 1210 aa30.54■■■□□ 2.48
SH3BP1-201ENST00000357436 PCGF6Q9BYE7 350 aa30.49■■■□□ 2.47
SH3BP1-201ENST00000357436 CCDC88BA6NC98 1476 aa30.3■■■□□ 2.44
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SH3BP1-201ENST00000357436 SMARCA2P51531 1590 aa30.16■■■□□ 2.42
SH3BP1-201ENST00000357436 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa30.08■■■□□ 2.41
SH3BP1-201ENST00000357436 ABCC8Q09428 1581 aa30.07■■■□□ 2.4
SH3BP1-201ENST00000357436 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP30.04■■■□□ 2.4
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SH3BP1-201ENST00000357436 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP29.95■■■□□ 2.39
SH3BP1-201ENST00000357436 PEG3Q9GZU2 1588 aa29.88■■■□□ 2.37
SH3BP1-201ENST00000357436 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP29.79■■■□□ 2.36
SH3BP1-201ENST00000357436 SOGA1O94964 1423 aa29.64■■■□□ 2.34
SH3BP1-201ENST00000357436 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa29.58■■■□□ 2.33
SH3BP1-201ENST00000357436 NCAPD3P42695 1498 aa29.55■■■□□ 2.32
SH3BP1-201ENST00000357436 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP29.55■■■□□ 2.321e-323■■■■■ 56.5
SH3BP1-201ENST00000357436 SYNJ1O43426 1573 aa29.42■■■□□ 2.3
SH3BP1-201ENST00000357436 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP29.38■■■□□ 2.29
SH3BP1-201ENST00000357436 HMGXB3Q12766 1538 aa29.38■■■□□ 2.29
SH3BP1-201ENST00000357436 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa29.36■■■□□ 2.29
SH3BP1-201ENST00000357436 CSRNP3Q8WYN3 585 aa29.34■■■□□ 2.29
SH3BP1-201ENST00000357436 DNAJC5BQ9UF47 199 aa29.32■■■□□ 2.28
SH3BP1-201ENST00000357436 UBTFP17480 764 aaKnown RBP29.31■■■□□ 2.28
SH3BP1-201ENST00000357436 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP29.27■■■□□ 2.28
SH3BP1-201ENST00000357436 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP29.26■■■□□ 2.27
SH3BP1-201ENST00000357436 EEA1Q15075 1411 aa29.18■■■□□ 2.26
SH3BP1-201ENST00000357436 CFTRP13569 1480 aa29.13■■■□□ 2.25
SH3BP1-201ENST00000357436 TNIKQ9UKE5 1360 aa29.09■■■□□ 2.25
SH3BP1-201ENST00000357436 CEP162Q5TB80 1403 aa29.07■■■□□ 2.24
SH3BP1-201ENST00000357436 CADPSQ9ULU8 1353 aa29.04■■■□□ 2.24
SH3BP1-201ENST00000357436 CUX1P39880 1505 aa29.03■■■□□ 2.24
SH3BP1-201ENST00000357436 NESP48681 1621 aa29■■■□□ 2.23
SH3BP1-201ENST00000357436 TOP2BQ02880 1626 aa28.99■■■□□ 2.23
SH3BP1-201ENST00000357436 GOLGA3Q08378 1498 aa28.92■■■□□ 2.22
SH3BP1-201ENST00000357436 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa28.9■■■□□ 2.22
SH3BP1-201ENST00000357436 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa28.82■■■□□ 2.2
SH3BP1-201ENST00000357436 CEP164Q9UPV0 1460 aa28.8■■■□□ 2.2
SH3BP1-201ENST00000357436 KIF21BO75037 1637 aa28.79■■■□□ 2.2
SH3BP1-201ENST00000357436 FANCD2Q9BXW9 1451 aa28.77■■■□□ 2.2
SH3BP1-201ENST00000357436 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP28.76■■■□□ 2.19
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SH3BP1-201ENST00000357436 CUX2O14529 1486 aa28.67■■■□□ 2.18
SH3BP1-201ENST00000357436 FGD5Q6ZNL6 1462 aa28.67■■■□□ 2.18
SH3BP1-201ENST00000357436 KIF27Q86VH2 1401 aa28.66■■■□□ 2.18
SH3BP1-201ENST00000357436 CLIP1P30622 1438 aa28.66■■■□□ 2.18
SH3BP1-201ENST00000357436 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa28.61■■■□□ 2.17
SH3BP1-201ENST00000357436 PRDM2Q13029 1718 aa28.58■■■□□ 2.17
SH3BP1-201ENST00000357436 PRXQ9BXM0 1461 aa28.55■■■□□ 2.16
SH3BP1-201ENST00000357436 IGF1RP08069 1367 aa28.51■■■□□ 2.15
SH3BP1-201ENST00000357436 TOPBP1Q92547 1522 aa28.46■■■□□ 2.15
SH3BP1-201ENST00000357436 VPS8Q8N3P4 1428 aa28.45■■■□□ 2.14
SH3BP1-201ENST00000357436 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP28.43■■■□□ 2.14
SH3BP1-201ENST00000357436 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP28.41■■■□□ 2.14
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SH3BP1-201ENST00000357436 P3H3Q8IVL6 736 aa28.37■■■□□ 2.13
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SH3BP1-201ENST00000357436 DNMBPQ6XZF7 1577 aa28.35■■■□□ 2.13
SH3BP1-201ENST00000357436 ERICH3Q5RHP9 1530 aa28.35■■■□□ 2.13
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SH3BP1-201ENST00000357436 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa28.28■■■□□ 2.12
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SH3BP1-201ENST00000357436 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP28.21■■■□□ 2.11
SH3BP1-201ENST00000357436 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP28.18■■■□□ 2.1
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SH3BP1-201ENST00000357436 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa28.16■■■□□ 2.1
SH3BP1-201ENST00000357436 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP28.12■■■□□ 2.09
SH3BP1-201ENST00000357436 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP28.05■■■□□ 2.082e-6■■■■■ 30.4
SH3BP1-201ENST00000357436 GAPVD1Q14C86 1478 aa28.02■■■□□ 2.08
SH3BP1-201ENST00000357436 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP27.97■■■□□ 2.07
SH3BP1-201ENST00000357436 FHOD3Q2V2M9 1422 aa27.96■■■□□ 2.07
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