Protein–RNA interactions for Protein: Q99471

PFDN5, Prefoldin subunit 5, humanhuman

Predictions only

Length 154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PFDN5Q99471 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PFDN5Q99471 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PFDN5Q99471 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PFDN5Q99471 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PFDN5Q99471 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PFDN5Q99471 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PFDN5Q99471 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PFDN5Q99471 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PFDN5Q99471 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PFDN5Q99471 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
PFDN5Q99471 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
PFDN5Q99471 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PFDN5Q99471 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
PFDN5Q99471 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
PFDN5Q99471 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PFDN5Q99471 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PFDN5Q99471 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PFDN5Q99471 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PFDN5Q99471 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PFDN5Q99471 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PFDN5Q99471 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PFDN5Q99471 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PFDN5Q99471 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PFDN5Q99471 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PFDN5Q99471 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
PFDN5Q99471 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PFDN5Q99471 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PFDN5Q99471 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PFDN5Q99471 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PFDN5Q99471 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PFDN5Q99471 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PFDN5Q99471 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PFDN5Q99471 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PFDN5Q99471 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PFDN5Q99471 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PFDN5Q99471 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PFDN5Q99471 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
PFDN5Q99471 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PFDN5Q99471 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PFDN5Q99471 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PFDN5Q99471 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PFDN5Q99471 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PFDN5Q99471 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PFDN5Q99471 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PFDN5Q99471 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PFDN5Q99471 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PFDN5Q99471 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PFDN5Q99471 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PFDN5Q99471 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PFDN5Q99471 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PFDN5Q99471 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PFDN5Q99471 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PFDN5Q99471 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PFDN5Q99471 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PFDN5Q99471 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PFDN5Q99471 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PFDN5Q99471 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PFDN5Q99471 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PFDN5Q99471 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PFDN5Q99471 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PFDN5Q99471 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PFDN5Q99471 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PFDN5Q99471 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PFDN5Q99471 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PFDN5Q99471 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PFDN5Q99471 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PFDN5Q99471 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PFDN5Q99471 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PFDN5Q99471 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PFDN5Q99471 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PFDN5Q99471 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PFDN5Q99471 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PFDN5Q99471 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PFDN5Q99471 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PFDN5Q99471 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PFDN5Q99471 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PFDN5Q99471 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PFDN5Q99471 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PFDN5Q99471 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
PFDN5Q99471 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PFDN5Q99471 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PFDN5Q99471 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PFDN5Q99471 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PFDN5Q99471 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PFDN5Q99471 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PFDN5Q99471 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PFDN5Q99471 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PFDN5Q99471 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PFDN5Q99471 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PFDN5Q99471 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PFDN5Q99471 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PFDN5Q99471 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PFDN5Q99471 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PFDN5Q99471 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PFDN5Q99471 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PFDN5Q99471 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PFDN5Q99471 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PFDN5Q99471 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PFDN5Q99471 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PFDN5Q99471 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms