Protein–RNA interactions for Protein: O00515

LAD1, Ladinin-1, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAD1O00515 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LAD1O00515 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LAD1O00515 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LAD1O00515 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LAD1O00515 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LAD1O00515 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LAD1O00515 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LAD1O00515 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LAD1O00515 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LAD1O00515 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LAD1O00515 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LAD1O00515 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LAD1O00515 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LAD1O00515 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LAD1O00515 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LAD1O00515 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LAD1O00515 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LAD1O00515 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LAD1O00515 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LAD1O00515 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LAD1O00515 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LAD1O00515 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LAD1O00515 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LAD1O00515 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
LAD1O00515 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LAD1O00515 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LAD1O00515 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LAD1O00515 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LAD1O00515 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LAD1O00515 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LAD1O00515 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LAD1O00515 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LAD1O00515 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LAD1O00515 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LAD1O00515 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LAD1O00515 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LAD1O00515 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LAD1O00515 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LAD1O00515 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LAD1O00515 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LAD1O00515 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LAD1O00515 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LAD1O00515 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LAD1O00515 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LAD1O00515 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LAD1O00515 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LAD1O00515 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LAD1O00515 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LAD1O00515 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LAD1O00515 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LAD1O00515 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LAD1O00515 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LAD1O00515 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
LAD1O00515 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LAD1O00515 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LAD1O00515 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LAD1O00515 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LAD1O00515 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LAD1O00515 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LAD1O00515 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LAD1O00515 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LAD1O00515 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LAD1O00515 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LAD1O00515 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LAD1O00515 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LAD1O00515 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LAD1O00515 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LAD1O00515 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LAD1O00515 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
LAD1O00515 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LAD1O00515 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LAD1O00515 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LAD1O00515 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LAD1O00515 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LAD1O00515 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LAD1O00515 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LAD1O00515 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
LAD1O00515 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LAD1O00515 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LAD1O00515 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LAD1O00515 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LAD1O00515 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LAD1O00515 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LAD1O00515 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LAD1O00515 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LAD1O00515 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LAD1O00515 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LAD1O00515 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LAD1O00515 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LAD1O00515 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LAD1O00515 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LAD1O00515 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LAD1O00515 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LAD1O00515 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LAD1O00515 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LAD1O00515 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LAD1O00515 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LAD1O00515 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LAD1O00515 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
LAD1O00515 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.8 ms