Protein–RNA interactions for Protein: P39548

YAR028W, DUP240 protein YAR028W, yeastyeast

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Length 234 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YAR028WP39548 ISM1YPL040C 3009 nt3.92□□□□□ -1.78
YAR028WP39548 SPC72YAL047C 1869 nt3.92□□□□□ -1.78
YAR028WP39548 ATG2YNL242W 4779 nt3.92□□□□□ -1.78
YAR028WP39548 GAL11YOL051W 3246 nt3.92□□□□□ -1.78
YAR028WP39548 YDR183C-AYDR183C-A 258 nt3.92□□□□□ -1.78
YAR028WP39548 YER076W-AYER076W-A 348 nt3.92□□□□□ -1.78
YAR028WP39548 tW(UCA)QtW(UCA)Q 74 nt3.92□□□□□ -1.78
YAR028WP39548 LSM8YJR022W 330 nt3.92□□□□□ -1.78
YAR028WP39548 BLI1YKL061W 342 nt3.92□□□□□ -1.78
YAR028WP39548 RPS7BYNL096C 573 nt3.92□□□□□ -1.78
YAR028WP39548 GCR1YPL075W 2358 nt3.92□□□□□ -1.78
YAR028WP39548 YDL180WYDL180W 1644 nt3.92□□□□□ -1.78
YAR028WP39548 YKL222CYKL222C 2118 nt3.91□□□□□ -1.78
YAR028WP39548 VMA1YDL185W 3216 nt3.91□□□□□ -1.78
YAR028WP39548 YGL152CYGL152C 678 nt3.91□□□□□ -1.78
YAR028WP39548 SGN1YIR001C 753 nt3.91□□□□□ -1.78
YAR028WP39548 EMP70YLR083C 2004 nt3.91□□□□□ -1.78
YAR028WP39548 MGR2YPL098C 342 nt3.91□□□□□ -1.78
YAR028WP39548 SLM6YBR266C 453 nt3.91□□□□□ -1.78
YAR028WP39548 IMH1YLR309C 2736 nt3.91□□□□□ -1.78
YAR028WP39548 SRP72YPL210C 1923 nt3.9□□□□□ -1.78
YAR028WP39548 HBT1YDL223C 3141 nt3.9□□□□□ -1.79
YAR028WP39548 MSL1YIR009W 336 nt3.9□□□□□ -1.79
YAR028WP39548 YIR040CYIR040C 333 nt3.9□□□□□ -1.79
YAR028WP39548 YJL015CYJL015C 285 nt3.9□□□□□ -1.79
YAR028WP39548 FMP46YKR049C 402 nt3.9□□□□□ -1.79
YAR028WP39548 LSM2YBL026W 288 nt3.9□□□□□ -1.79
YAR028WP39548 FSH3YOR280C 801 nt3.9□□□□□ -1.79
YAR028WP39548 NUP85YJR042W 2235 nt3.9□□□□□ -1.79
YAR028WP39548 NUP133YKR082W 3474 nt3.9□□□□□ -1.79
YAR028WP39548 PHM7YOL084W 2976 nt3.89□□□□□ -1.79
YAR028WP39548 YEL018C-AYEL018C-A 534 nt3.89□□□□□ -1.79
YAR028WP39548 CAJ1YER048C 1176 nt3.89□□□□□ -1.79
YAR028WP39548 NOP19YGR251W 591 nt3.89□□□□□ -1.79
YAR028WP39548 YGR265WYGR265W 411 nt3.89□□□□□ -1.79
YAR028WP39548 YKL033W-AYKL033W-A 711 nt3.89□□□□□ -1.79
YAR028WP39548 FCF2YLR051C 654 nt3.89□□□□□ -1.79
YAR028WP39548 SWC7YLR385C 399 nt3.89□□□□□ -1.79
YAR028WP39548 COX7YMR256C 183 nt3.89□□□□□ -1.79
YAR028WP39548 SSN8YNL025C 972 nt3.89□□□□□ -1.79
YAR028WP39548 CBP2YHL038C 1893 nt3.89□□□□□ -1.79
YAR028WP39548 PIM1YBL022C 3402 nt3.89□□□□□ -1.79
YAR028WP39548 SRB4YER022W 2064 nt3.88□□□□□ -1.79
YAR028WP39548 YER066C-AYER066C-A 501 nt3.88□□□□□ -1.79
YAR028WP39548 RPL29YFR032C-A 180 nt3.88□□□□□ -1.79
YAR028WP39548 MRPL20YKR085C 588 nt3.88□□□□□ -1.79
YAR028WP39548 YPL238CYPL238C 390 nt3.88□□□□□ -1.79
YAR028WP39548 YSH1YLR277C 2340 nt3.88□□□□□ -1.79
YAR028WP39548 POL1YNL102W 4407 nt3.87□□□□□ -1.79
YAR028WP39548 YKL100CYKL100C 1764 nt3.87□□□□□ -1.79
YAR028WP39548 ERG28YER044C 447 nt3.87□□□□□ -1.79
YAR028WP39548 RPS0AYGR214W 759 nt3.87□□□□□ -1.79
YAR028WP39548 EFB1YAL003W 621 nt3.87□□□□□ -1.79
YAR028WP39548 RPS21BYJL136C 264 nt3.87□□□□□ -1.79
YAR028WP39548 PDS5YMR076C 3834 nt3.87□□□□□ -1.79
YAR028WP39548 NDD1YOR372C 1665 nt3.87□□□□□ -1.79
YAR028WP39548 ATG21YPL100W 1491 nt3.86□□□□□ -1.79
YAR028WP39548 KIN82YCR091W 2163 nt3.86□□□□□ -1.79
YAR028WP39548 YFL063WYFL063W 456 nt3.86□□□□□ -1.79
YAR028WP39548 PXR1YGR280C 816 nt3.86□□□□□ -1.79
YAR028WP39548 RPL15AYLR029C 615 nt3.86□□□□□ -1.79
YAR028WP39548 PRE8YML092C 753 nt3.86□□□□□ -1.79
YAR028WP39548 YMR046W-AYMR046W-A 129 nt3.86□□□□□ -1.79
YAR028WP39548 PGA1YNL158W 597 nt3.86□□□□□ -1.79
YAR028WP39548 RPB11YOL005C 363 nt3.86□□□□□ -1.79
YAR028WP39548 SRO7YPR032W 3102 nt3.86□□□□□ -1.79
YAR028WP39548 ECM22YLR228C 2445 nt3.86□□□□□ -1.79
YAR028WP39548 SSH4YKL124W 1740 nt3.86□□□□□ -1.79
YAR028WP39548 YLR001CYLR001C 2589 nt3.86□□□□□ -1.79
YAR028WP39548 SPC19YDR201W 498 nt3.85□□□□□ -1.79
YAR028WP39548 RMT2YDR465C 1239 nt3.85□□□□□ -1.79
YAR028WP39548 YNL198CYNL198C 303 nt3.85□□□□□ -1.79
YAR028WP39548 NCR1YPL006W 3513 nt3.84□□□□□ -1.79
YAR028WP39548 NOT5YPR072W 1683 nt3.84□□□□□ -1.79
YAR028WP39548 YBP1YBR216C 2025 nt3.84□□□□□ -1.79
YAR028WP39548 FRE8YLR047C 2061 nt3.84□□□□□ -1.79
YAR028WP39548 CYC7YEL039C 342 nt3.84□□□□□ -1.79
YAR028WP39548 RAD6YGL058W 519 nt3.84□□□□□ -1.79
YAR028WP39548 BCD1YHR040W 1101 nt3.84□□□□□ -1.79
YAR028WP39548 YKL156C-AYKL156C-A 117 nt3.84□□□□□ -1.79
YAR028WP39548 TVP18YMR071C 504 nt3.84□□□□□ -1.79
YAR028WP39548 HCH1YNL281W 462 nt3.84□□□□□ -1.79
YAR028WP39548 LYS9YNR050C 1341 nt3.84□□□□□ -1.79
YAR028WP39548 SMI1YGR229C 1518 nt3.84□□□□□ -1.8
YAR028WP39548 YSW1YBR148W 1830 nt3.84□□□□□ -1.8
YAR028WP39548 FAA1YOR317W 2103 nt3.83□□□□□ -1.8
YAR028WP39548 RPB2YOR151C 3675 nt3.83□□□□□ -1.8
YAR028WP39548 HMG1YML075C 3165 nt3.83□□□□□ -1.8
YAR028WP39548 HMF1YER057C 390 nt3.83□□□□□ -1.8
YAR028WP39548 RPC10YHR143W-A 213 nt3.83□□□□□ -1.8
YAR028WP39548 YJL197C-AYJL197C-A 282 nt3.83□□□□□ -1.8
YAR028WP39548 YAL056C-AYAL056C-A 351 nt3.83□□□□□ -1.8
YAR028WP39548 YPR099CYPR099C 357 nt3.83□□□□□ -1.8
YAR028WP39548 DPH6YLR143W 2058 nt3.83□□□□□ -1.8
YAR028WP39548 ACE2YLR131C 2313 nt3.83□□□□□ -1.8
YAR028WP39548 CWH41YGL027C 2502 nt3.82□□□□□ -1.8
YAR028WP39548 YFR056CYFR056C 369 nt3.82□□□□□ -1.8
YAR028WP39548 RPL37AYLR185W 267 nt3.82□□□□□ -1.8
YAR028WP39548 ATG33YLR356W 594 nt3.82□□□□□ -1.8
YAR028WP39548 ASC1YMR116C 960 nt3.82□□□□□ -1.8
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