RNA–Protein interactions for RNA: YJL015C

YJL015C, Transcript of Dubious open reading frame unlikely to encode a functional protein, yeastyeast

Gene YJL015C, Length 285 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YJL015CYJL015C MTC1P47018 478 aaKnown RBP11.77□□□□□ -0.53
YJL015CYJL015C FAP1P53971 965 aa11.11□□□□□ -0.63
YJL015CYJL015C DRS1P32892 752 aaKnown RBP10.48□□□□□ -0.73
YJL015CYJL015C PRY3P47033 881 aa10.48□□□□□ -0.73
YJL015CYJL015C PRI1P10363 409 aa10.21□□□□□ -0.77
YJL015CYJL015C AAD16Q02895 342 aa10.19□□□□□ -0.78
YJL015CYJL015C YCK3P39962 524 aa9.96□□□□□ -0.82
YJL015CYJL015C ISW2Q08773 1120 aa9.83□□□□□ -0.84
YJL015CYJL015C HAA1Q12753 694 aaKnown RBP9.8□□□□□ -0.84
YJL015CYJL015C RPG1P38249 964 aaKnown RBP9.77□□□□□ -0.85
YJL015CYJL015C TSR3Q12094 313 aaKnown RBP9.61□□□□□ -0.87
YJL015CYJL015C DIP2Q12220 943 aaPredicted RBP9.38□□□□□ -0.91
YJL015CYJL015C MRPL32P25348 183 aa9.21□□□□□ -0.94
YJL015CYJL015C RSE1Q04693 1361 aaKnown RBP9.19□□□□□ -0.94
YJL015CYJL015C YGL015CP33199 130 aa8.98□□□□□ -0.97
YJL015CYJL015C RPL17AP05740 184 aaKnown RBP8.94□□□□□ -0.98
YJL015CYJL015C RPL17BP46990 184 aaKnown RBP8.94□□□□□ -0.98
YJL015CYJL015C AVT3P36062 692 aa8.93□□□□□ -0.98
YJL015CYJL015C REB1P21538 810 aa8.92□□□□□ -0.98
YJL015CYJL015C CDC27P38042 758 aa8.71□□□□□ -1.02
YJL015CYJL015C YKR023WP36119 530 aaKnown RBP8.57□□□□□ -1.04
YJL015CYJL015C SPT21P35209 758 aa8.56□□□□□ -1.04
YJL015CYJL015C UBP10P53874 792 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
YJL015CYJL015C MAP2P38174 421 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
YJL015CYJL015C BUD31P25337 157 aaPredicted RBP8.47□□□□□ -1.05
YJL015CYJL015C BFR2Q06631 534 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
YJL015CYJL015C TFC8Q12308 588 aa8.39□□□□□ -1.07
YJL015CYJL015C HOP09932 586 aa8.38□□□□□ -1.07
YJL015CYJL015C DCD1P06773 312 aa8.36□□□□□ -1.07
YJL015CYJL015C SCY1P53009 804 aa8.21□□□□□ -1.1
YJL015CYJL015C RIM101P33400 625 aa8.14□□□□□ -1.11
YJL015CYJL015C TIF4632P39936 914 aaKnown RBP8.13□□□□□ -1.11
YJL015CYJL015C TGL3P40308 642 aa8.13□□□□□ -1.11
YJL015CYJL015C SLX5P32828 619 aaKnown RBP8.12□□□□□ -1.11
YJL015CYJL015C BCH2P36122 765 aa8.09□□□□□ -1.11
YJL015CYJL015C UBP9P39967 754 aa8□□□□□ -1.13
YJL015CYJL015C SIS1P25294 352 aaKnown RBP7.98□□□□□ -1.13
YJL015CYJL015C OXP1P28273 1286 aa7.85□□□□□ -1.15
YJL015CYJL015C EPS1P40557 701 aa7.85□□□□□ -1.15
YJL015CYJL015C BDF1P35817 686 aa7.84□□□□□ -1.15
YJL015CYJL015C MST1P07236 462 aa7.76□□□□□ -1.17
YJL015CYJL015C PTP3P40048 928 aa7.71□□□□□ -1.18
YJL015CYJL015C YBL029C-AQ3E756 94 aa7.69□□□□□ -1.18
YJL015CYJL015C YIL055CP40523 627 aaKnown RBP7.68□□□□□ -1.18
YJL015CYJL015C YOR238WQ08634 303 aa7.67□□□□□ -1.18
YJL015CYJL015C NSR1P27476 414 aaKnown RBP RIP-Chip data7.63□□□□□ -1.19not detected
YJL015CYJL015C RSM7P47150 247 aa7.6□□□□□ -1.19
YJL015CYJL015C VNX1P42839 908 aa7.59□□□□□ -1.19
YJL015CYJL015C BBC1P47068 1157 aa7.59□□□□□ -1.19
YJL015CYJL015C AI2P03876 854 aa7.58□□□□□ -1.2
YJL015CYJL015C YAP5P40574 245 aa7.55□□□□□ -1.2
YJL015CYJL015C YAH1Q12184 172 aaKnown RBP7.52□□□□□ -1.21
YJL015CYJL015C SPP1Q03012 353 aa7.5□□□□□ -1.21
YJL015CYJL015C WSC3Q12215 556 aa7.48□□□□□ -1.21
YJL015CYJL015C TIF11P38912 153 aaKnown RBP7.41□□□□□ -1.22
YJL015CYJL015C YLR271WQ06152 274 aa7.41□□□□□ -1.22
YJL015CYJL015C AIR2Q12476 344 aaKnown RBP7.41□□□□□ -1.22
YJL015CYJL015C FKH1P40466 484 aa7.39□□□□□ -1.23
YJL015CYJL015C GTT3P39996 337 aa7.37□□□□□ -1.23
YJL015CYJL015C PSD2P53037 1138 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
YJL015CYJL015C PIB1Q06651 286 aa7.32□□□□□ -1.24
YJL015CYJL015C YJL171CP46992 396 aa7.31□□□□□ -1.24
YJL015CYJL015C LDB19Q12502 818 aa7.3□□□□□ -1.24
YJL015CYJL015C IOC2Q12072 812 aa7.29□□□□□ -1.24
YJL015CYJL015C MRM1P25270 412 aa7.28□□□□□ -1.24
YJL015CYJL015C ULI1P43604 169 aa7.28□□□□□ -1.24
YJL015CYJL015C TFA1P36100 482 aa7.26□□□□□ -1.25
YJL015CYJL015C MSB4Q12317 492 aa7.21□□□□□ -1.26
YJL015CYJL015C BMT6Q12291 365 aa7.2□□□□□ -1.26
YJL015CYJL015C EAP1P36041 632 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
YJL015CYJL015C SSP1P38871 571 aa7.16□□□□□ -1.26
YJL015CYJL015C YOL036WQ08206 761 aa7.16□□□□□ -1.26
YJL015CYJL015C VPS29P38759 282 aa7.15□□□□□ -1.26
YJL015CYJL015C SET4P42948 560 aa7.15□□□□□ -1.26
YJL015CYJL015C ARP8Q12386 881 aaKnown RBP RIP-Chip data7.15□□□□□ -1.26not detected
YJL015CYJL015C YMR1P47147 688 aaKnown RBP RIP-Chip data7.14□□□□□ -1.27not detected
YJL015CYJL015C TRP5P00931 707 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
YJL015CYJL015C RTG1P32607 177 aa7.13□□□□□ -1.27
YJL015CYJL015C DBP1P24784 617 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
YJL015CYJL015C CST9Q06032 482 aa7.12□□□□□ -1.27
YJL015CYJL015C YFR006WP43590 535 aa7.1□□□□□ -1.27
YJL015CYJL015C STS1P38637 319 aa7.09□□□□□ -1.27
YJL015CYJL015C NCR1Q12200 1170 aa7.09□□□□□ -1.27
YJL015CYJL015C VMA1P17255 1071 aaKnown RBP7.08□□□□□ -1.28
YJL015CYJL015C RTG3P38165 486 aa7.07□□□□□ -1.28
YJL015CYJL015C YNL035CP53962 389 aaKnown RBP7.06□□□□□ -1.28
YJL015CYJL015C SAM3Q08986 587 aa7.06□□□□□ -1.28
YJL015CYJL015C SEC61P32915 480 aa7.05□□□□□ -1.28
YJL015CYJL015C MGA2P40578 1113 aa7.04□□□□□ -1.28
YJL015CYJL015C RCR1P38212 213 aa7.01□□□□□ -1.29
YJL015CYJL015C DAN4P47179 1161 aa6.97□□□□□ -1.29
YJL015CYJL015C JIP4Q03361 876 aa6.93□□□□□ -1.3
YJL015CYJL015C SAP30P38429 201 aa6.92□□□□□ -1.3
YJL015CYJL015C TFG1P41895 735 aaPredicted RBP6.92□□□□□ -1.3
YJL015CYJL015C GYP5Q12344 894 aa6.92□□□□□ -1.3
YJL015CYJL015C ABP1P15891 592 aaKnown RBP6.91□□□□□ -1.3
YJL015CYJL015C YDL129WQ07555 291 aa6.89□□□□□ -1.31
YJL015CYJL015C HTA1P04911 132 aaKnown RBP6.88□□□□□ -1.31
YJL015CYJL015C HTA2P04912 132 aa6.88□□□□□ -1.31
YJL015CYJL015C DCW1P36091 449 aa6.87□□□□□ -1.31
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 13.4 ms