Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z5U6

WDR53, WD repeat-containing protein 53, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR53Q7Z5U6 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
WDR53Q7Z5U6 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
WDR53Q7Z5U6 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
WDR53Q7Z5U6 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
WDR53Q7Z5U6 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
WDR53Q7Z5U6 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
WDR53Q7Z5U6 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
WDR53Q7Z5U6 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
WDR53Q7Z5U6 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
WDR53Q7Z5U6 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
WDR53Q7Z5U6 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
WDR53Q7Z5U6 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
WDR53Q7Z5U6 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
WDR53Q7Z5U6 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
WDR53Q7Z5U6 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
WDR53Q7Z5U6 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
WDR53Q7Z5U6 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
WDR53Q7Z5U6 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
WDR53Q7Z5U6 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
WDR53Q7Z5U6 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
WDR53Q7Z5U6 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
WDR53Q7Z5U6 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
WDR53Q7Z5U6 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
WDR53Q7Z5U6 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
WDR53Q7Z5U6 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
WDR53Q7Z5U6 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
WDR53Q7Z5U6 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
WDR53Q7Z5U6 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
WDR53Q7Z5U6 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
WDR53Q7Z5U6 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
WDR53Q7Z5U6 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
WDR53Q7Z5U6 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
WDR53Q7Z5U6 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
WDR53Q7Z5U6 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
WDR53Q7Z5U6 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
WDR53Q7Z5U6 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
WDR53Q7Z5U6 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC19.52■□□□□ 0.71
WDR53Q7Z5U6 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
WDR53Q7Z5U6 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
WDR53Q7Z5U6 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
WDR53Q7Z5U6 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
WDR53Q7Z5U6 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
WDR53Q7Z5U6 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
WDR53Q7Z5U6 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
WDR53Q7Z5U6 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
WDR53Q7Z5U6 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
WDR53Q7Z5U6 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
WDR53Q7Z5U6 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
WDR53Q7Z5U6 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
WDR53Q7Z5U6 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
WDR53Q7Z5U6 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
WDR53Q7Z5U6 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
WDR53Q7Z5U6 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
WDR53Q7Z5U6 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
WDR53Q7Z5U6 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
WDR53Q7Z5U6 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
WDR53Q7Z5U6 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
WDR53Q7Z5U6 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
WDR53Q7Z5U6 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
WDR53Q7Z5U6 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
WDR53Q7Z5U6 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
WDR53Q7Z5U6 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
WDR53Q7Z5U6 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
WDR53Q7Z5U6 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
WDR53Q7Z5U6 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
WDR53Q7Z5U6 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
WDR53Q7Z5U6 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
WDR53Q7Z5U6 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
WDR53Q7Z5U6 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
WDR53Q7Z5U6 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
WDR53Q7Z5U6 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
WDR53Q7Z5U6 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
WDR53Q7Z5U6 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
WDR53Q7Z5U6 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
WDR53Q7Z5U6 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
WDR53Q7Z5U6 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
WDR53Q7Z5U6 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
WDR53Q7Z5U6 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
WDR53Q7Z5U6 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
WDR53Q7Z5U6 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
WDR53Q7Z5U6 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
WDR53Q7Z5U6 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
WDR53Q7Z5U6 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
WDR53Q7Z5U6 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
WDR53Q7Z5U6 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
WDR53Q7Z5U6 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
WDR53Q7Z5U6 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
WDR53Q7Z5U6 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC19.49■□□□□ 0.71
WDR53Q7Z5U6 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
WDR53Q7Z5U6 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
WDR53Q7Z5U6 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
WDR53Q7Z5U6 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
WDR53Q7Z5U6 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
WDR53Q7Z5U6 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
WDR53Q7Z5U6 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
WDR53Q7Z5U6 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
WDR53Q7Z5U6 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
WDR53Q7Z5U6 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
WDR53Q7Z5U6 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
WDR53Q7Z5U6 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms