Protein–RNA interactions for Protein: Q9UFW8

CGGBP1, CGG triplet repeat-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 167 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGGBP1Q9UFW8 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CGGBP1Q9UFW8 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
CGGBP1Q9UFW8 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CGGBP1Q9UFW8 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CGGBP1Q9UFW8 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CGGBP1Q9UFW8 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CGGBP1Q9UFW8 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CGGBP1Q9UFW8 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CGGBP1Q9UFW8 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CGGBP1Q9UFW8 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CGGBP1Q9UFW8 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CGGBP1Q9UFW8 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CGGBP1Q9UFW8 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CGGBP1Q9UFW8 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CGGBP1Q9UFW8 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CGGBP1Q9UFW8 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CGGBP1Q9UFW8 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CGGBP1Q9UFW8 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CGGBP1Q9UFW8 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
CGGBP1Q9UFW8 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CGGBP1Q9UFW8 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
CGGBP1Q9UFW8 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CGGBP1Q9UFW8 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CGGBP1Q9UFW8 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CGGBP1Q9UFW8 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CGGBP1Q9UFW8 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CGGBP1Q9UFW8 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CGGBP1Q9UFW8 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CGGBP1Q9UFW8 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CGGBP1Q9UFW8 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CGGBP1Q9UFW8 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CGGBP1Q9UFW8 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CGGBP1Q9UFW8 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CGGBP1Q9UFW8 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CGGBP1Q9UFW8 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CGGBP1Q9UFW8 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CGGBP1Q9UFW8 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CGGBP1Q9UFW8 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CGGBP1Q9UFW8 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CGGBP1Q9UFW8 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CGGBP1Q9UFW8 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CGGBP1Q9UFW8 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CGGBP1Q9UFW8 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CGGBP1Q9UFW8 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CGGBP1Q9UFW8 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CGGBP1Q9UFW8 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CGGBP1Q9UFW8 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CGGBP1Q9UFW8 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
CGGBP1Q9UFW8 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CGGBP1Q9UFW8 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CGGBP1Q9UFW8 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CGGBP1Q9UFW8 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CGGBP1Q9UFW8 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CGGBP1Q9UFW8 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CGGBP1Q9UFW8 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CGGBP1Q9UFW8 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CGGBP1Q9UFW8 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CGGBP1Q9UFW8 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CGGBP1Q9UFW8 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CGGBP1Q9UFW8 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CGGBP1Q9UFW8 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CGGBP1Q9UFW8 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CGGBP1Q9UFW8 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CGGBP1Q9UFW8 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CGGBP1Q9UFW8 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CGGBP1Q9UFW8 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CGGBP1Q9UFW8 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CGGBP1Q9UFW8 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CGGBP1Q9UFW8 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CGGBP1Q9UFW8 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CGGBP1Q9UFW8 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CGGBP1Q9UFW8 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CGGBP1Q9UFW8 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CGGBP1Q9UFW8 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CGGBP1Q9UFW8 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CGGBP1Q9UFW8 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CGGBP1Q9UFW8 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CGGBP1Q9UFW8 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CGGBP1Q9UFW8 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CGGBP1Q9UFW8 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CGGBP1Q9UFW8 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CGGBP1Q9UFW8 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CGGBP1Q9UFW8 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CGGBP1Q9UFW8 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CGGBP1Q9UFW8 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CGGBP1Q9UFW8 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CGGBP1Q9UFW8 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CGGBP1Q9UFW8 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CGGBP1Q9UFW8 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CGGBP1Q9UFW8 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CGGBP1Q9UFW8 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CGGBP1Q9UFW8 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CGGBP1Q9UFW8 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CGGBP1Q9UFW8 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CGGBP1Q9UFW8 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CGGBP1Q9UFW8 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CGGBP1Q9UFW8 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CGGBP1Q9UFW8 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CGGBP1Q9UFW8 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CGGBP1Q9UFW8 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
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