Protein–RNA interactions for Protein: Q96A33

CCDC47, Coiled-coil domain-containing protein 47, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC47Q96A33 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC47Q96A33 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC47Q96A33 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC47Q96A33 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC47Q96A33 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC47Q96A33 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC47Q96A33 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC47Q96A33 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC47Q96A33 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC47Q96A33 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC47Q96A33 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC47Q96A33 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC47Q96A33 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC47Q96A33 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC47Q96A33 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC47Q96A33 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC47Q96A33 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC47Q96A33 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC47Q96A33 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC47Q96A33 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC47Q96A33 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC47Q96A33 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC47Q96A33 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC47Q96A33 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC47Q96A33 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC47Q96A33 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC47Q96A33 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC47Q96A33 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC47Q96A33 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC47Q96A33 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC47Q96A33 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC47Q96A33 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC47Q96A33 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC47Q96A33 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC47Q96A33 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC47Q96A33 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC47Q96A33 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC47Q96A33 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC47Q96A33 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC47Q96A33 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC47Q96A33 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC47Q96A33 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC47Q96A33 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC47Q96A33 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC47Q96A33 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC47Q96A33 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC47Q96A33 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC47Q96A33 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC47Q96A33 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC47Q96A33 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC47Q96A33 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC47Q96A33 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC47Q96A33 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC47Q96A33 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC47Q96A33 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC47Q96A33 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC47Q96A33 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC47Q96A33 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC47Q96A33 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC47Q96A33 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC47Q96A33 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC47Q96A33 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC47Q96A33 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CCDC47Q96A33 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CCDC47Q96A33 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CCDC47Q96A33 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC47Q96A33 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC47Q96A33 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC47Q96A33 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC47Q96A33 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC47Q96A33 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC47Q96A33 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC47Q96A33 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC47Q96A33 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC47Q96A33 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC47Q96A33 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC47Q96A33 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC47Q96A33 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC47Q96A33 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC47Q96A33 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC47Q96A33 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC47Q96A33 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC47Q96A33 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC47Q96A33 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC47Q96A33 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC47Q96A33 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC47Q96A33 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC47Q96A33 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC47Q96A33 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC47Q96A33 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC47Q96A33 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC47Q96A33 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC47Q96A33 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC47Q96A33 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC47Q96A33 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC47Q96A33 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC47Q96A33 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC47Q96A33 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC47Q96A33 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC47Q96A33 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
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