Protein–RNA interactions for Protein: Q07657

SHS1, Seventh homolog of septin 1, yeastyeast

Predictions only

Length 551 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SHS1Q07657 TSC11YER093C 4293 nt2.87□□□□□ -1.95
SHS1Q07657 AYT1YLL063C 1425 nt2.87□□□□□ -1.95
SHS1Q07657 UBP8YMR223W 1416 nt2.87□□□□□ -1.95
SHS1Q07657 RUB1YDR139C 234 nt2.87□□□□□ -1.95
SHS1Q07657 YER165C-AYER165C-A 357 nt2.87□□□□□ -1.95
SHS1Q07657 YJR020WYJR020W 333 nt2.87□□□□□ -1.95
SHS1Q07657 SMD3YLR147C 306 nt2.87□□□□□ -1.95
SHS1Q07657 RPB8YOR224C 441 nt2.87□□□□□ -1.95
SHS1Q07657 YPL135C-AYPL135C-A 174 nt2.87□□□□□ -1.95
SHS1Q07657 DPB3YBR278W 606 nt2.87□□□□□ -1.95
SHS1Q07657 IRC3YDR332W 2070 nt2.87□□□□□ -1.95
SHS1Q07657 YPL216WYPL216W 3309 nt2.87□□□□□ -1.95
SHS1Q07657 SMC2YFR031C 3513 nt2.86□□□□□ -1.95
SHS1Q07657 YDL050CYDL050C 372 nt2.86□□□□□ -1.95
SHS1Q07657 YDL157CYDL157C 357 nt2.86□□□□□ -1.95
SHS1Q07657 PRE1YER012W 597 nt2.86□□□□□ -1.95
SHS1Q07657 SMX2YFL017W-A 234 nt2.86□□□□□ -1.95
SHS1Q07657 SRT1YMR101C 1032 nt2.86□□□□□ -1.95
SHS1Q07657 YBL055CYBL055C 1257 nt2.86□□□□□ -1.95
SHS1Q07657 YBL065WYBL065W 345 nt2.86□□□□□ -1.95
SHS1Q07657 YNL276CYNL276C 396 nt2.86□□□□□ -1.95
SHS1Q07657 YOR366WYOR366W 354 nt2.86□□□□□ -1.95
SHS1Q07657 SAD1YFR005C 1347 nt2.86□□□□□ -1.95
SHS1Q07657 MOT1YPL082C 5604 nt2.86□□□□□ -1.95
SHS1Q07657 ROM1YGR070W 3468 nt2.85□□□□□ -1.95
SHS1Q07657 ATG13YPR185W 2217 nt2.85□□□□□ -1.95
SHS1Q07657 GUK1YDR454C 564 nt2.85□□□□□ -1.95
SHS1Q07657 ERG25YGR060W 930 nt2.85□□□□□ -1.95
SHS1Q07657 RPA12YJR063W 378 nt2.85□□□□□ -1.95
SHS1Q07657 YKL065W-AYKL065W-A 222 nt2.85□□□□□ -1.95
SHS1Q07657 HAT1YPL001W 1125 nt2.85□□□□□ -1.95
SHS1Q07657 YBR201C-AYBR201C-A 204 nt2.85□□□□□ -1.95
SHS1Q07657 YGR067CYGR067C 2415 nt2.85□□□□□ -1.95
SHS1Q07657 TFC1YBR123C 1950 nt2.85□□□□□ -1.95
SHS1Q07657 ECM29YHL030W 5607 nt2.85□□□□□ -1.95
SHS1Q07657 HSE1YHL002W 1359 nt2.85□□□□□ -1.95
SHS1Q07657 RTG3YBL103C 1461 nt2.84□□□□□ -1.95
SHS1Q07657 YCG1YDR325W 3108 nt2.84□□□□□ -1.95
SHS1Q07657 TAO3YIL129C 7131 nt2.84□□□□□ -1.95
SHS1Q07657 MNT3YIL014W 1893 nt2.84□□□□□ -1.95
SHS1Q07657 RPN1YHR027C 2982 nt2.84□□□□□ -1.95
SHS1Q07657 YJL132WYJL132W 2253 nt2.84□□□□□ -1.95
SHS1Q07657 RPB9YGL070C 369 nt2.84□□□□□ -1.95
SHS1Q07657 OST5YGL226C-A 261 nt2.84□□□□□ -1.95
SHS1Q07657 SVP26YHR181W 687 nt2.84□□□□□ -1.95
SHS1Q07657 TDA8YAL064C-A 381 nt2.84□□□□□ -1.95
SHS1Q07657 LTP1YPR073C 486 nt2.84□□□□□ -1.95
SHS1Q07657 TFC4YGR047C 3078 nt2.84□□□□□ -1.96
SHS1Q07657 BUB1YGR188C 3066 nt2.84□□□□□ -1.96
SHS1Q07657 TOM70YNL121C 1854 nt2.84□□□□□ -1.96
SHS1Q07657 PEX6YNL329C 3093 nt2.83□□□□□ -1.96
SHS1Q07657 BNI4YNL233W 2679 nt2.83□□□□□ -1.96
SHS1Q07657 RIM1YCR028C-A 408 nt2.83□□□□□ -1.96
SHS1Q07657 YCR100CYCR100C 951 nt2.83□□□□□ -1.96
SHS1Q07657 snR68snR68 136 nt2.83□□□□□ -1.96
SHS1Q07657 TVP15YDR100W 432 nt2.83□□□□□ -1.96
SHS1Q07657 SEC4YFL005W 648 nt2.83□□□□□ -1.96
SHS1Q07657 COG7YGL005C 840 nt2.83□□□□□ -1.96
SHS1Q07657 RNR2YJL026W 1200 nt2.83□□□□□ -1.96
SHS1Q07657 YAL066WYAL066W 309 nt2.83□□□□□ -1.96
SHS1Q07657 SPC2YML055W 537 nt2.83□□□□□ -1.96
SHS1Q07657 RPL23AYBL087C 414 nt2.83□□□□□ -1.96
SHS1Q07657 TSR4YOL022C 1227 nt2.83□□□□□ -1.96
SHS1Q07657 YOR097CYOR097C 528 nt2.83□□□□□ -1.96
SHS1Q07657 CUP9YPL177C 921 nt2.83□□□□□ -1.96
SHS1Q07657 DNA2YHR164C 4569 nt2.82□□□□□ -1.96
SHS1Q07657 FKS3YMR306W 5358 nt2.82□□□□□ -1.96
SHS1Q07657 SRP68YPL243W 1800 nt2.82□□□□□ -1.96
SHS1Q07657 SPO71YDR104C 3738 nt2.82□□□□□ -1.96
SHS1Q07657 RTT105YER104W 627 nt2.82□□□□□ -1.96
SHS1Q07657 VMA7YGR020C 357 nt2.82□□□□□ -1.96
SHS1Q07657 YLR076CYLR076C 423 nt2.82□□□□□ -1.96
SHS1Q07657 YLR169WYLR169W 354 nt2.82□□□□□ -1.96
SHS1Q07657 YNL226WYNL226W 411 nt2.82□□□□□ -1.96
SHS1Q07657 YOL106WYOL106W 354 nt2.82□□□□□ -1.96
SHS1Q07657 YOL114CYOL114C 609 nt2.82□□□□□ -1.96
SHS1Q07657 RED1YLR263W 2484 nt2.82□□□□□ -1.96
SHS1Q07657 DUF1YOL087C 3351 nt2.81□□□□□ -1.96
SHS1Q07657 TOM1YDR457W 9807 nt2.81□□□□□ -1.96
SHS1Q07657 NAB6YML117W 3405 nt2.81□□□□□ -1.96
SHS1Q07657 RPL13AYDL082W 600 nt2.81□□□□□ -1.96
SHS1Q07657 YFR057WYFR057W 456 nt2.81□□□□□ -1.96
SHS1Q07657 YGR160WYGR160W 612 nt2.81□□□□□ -1.96
SHS1Q07657 PHD1YKL043W 1101 nt2.81□□□□□ -1.96
SHS1Q07657 RPL6BYLR448W 531 nt2.81□□□□□ -1.96
SHS1Q07657 PEX34YCL056C 435 nt2.81□□□□□ -1.96
SHS1Q07657 MMS1YPR164W 4224 nt2.81□□□□□ -1.96
SHS1Q07657 MUS81YDR386W 1899 nt2.81□□□□□ -1.96
SHS1Q07657 GYL1YMR192W 2163 nt2.81□□□□□ -1.96
SHS1Q07657 EXO84YBR102C 2262 nt2.81□□□□□ -1.96
SHS1Q07657 TIF4631YGR162W 2859 nt2.81□□□□□ -1.96
SHS1Q07657 MED1YPR070W 1701 nt2.8□□□□□ -1.96
SHS1Q07657 TRM82YDR165W 1335 nt2.8□□□□□ -1.96
SHS1Q07657 YNL011CYNL011C 1335 nt2.8□□□□□ -1.96
SHS1Q07657 YCR045W-AYCR045W-A 351 nt2.8□□□□□ -1.96
SHS1Q07657 ERP3YDL018C 678 nt2.8□□□□□ -1.96
SHS1Q07657 RMT2YDR465C 1239 nt2.8□□□□□ -1.96
SHS1Q07657 MAM1YER106W 909 nt2.8□□□□□ -1.96
SHS1Q07657 YFH7YFR007W 1062 nt2.8□□□□□ -1.96
SHS1Q07657 PEX18YHR160C 852 nt2.8□□□□□ -1.96
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 362.9 ms