Protein–RNA interactions for Protein: Q07657

SHS1, Seventh homolog of septin 1, yeastyeast

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Length 551 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SHS1Q07657 YML009W-BYML009W-B 477 nt22.17■■□□□ 1.14
SHS1Q07657 NSR1YGR159C 1245 nt21.93■■□□□ 1.1
SHS1Q07657 NOP1YDL014W 984 nt21.62■■□□□ 1.05
SHS1Q07657 YKL036CYKL036C 393 nt20.1■□□□□ 0.81
SHS1Q07657 MDJ1YFL016C 1536 nt19.33■□□□□ 0.68
SHS1Q07657 Q0297Q0297 156 nt19.02■□□□□ 0.64
SHS1Q07657 SRX1YKL086W 384 nt18.92■□□□□ 0.62
SHS1Q07657 YJL027CYJL027C 417 nt18.77■□□□□ 0.6
SHS1Q07657 SCS3YGL126W 1143 nt18.38■□□□□ 0.53
SHS1Q07657 YCR051WYCR051W 669 nt17.92■□□□□ 0.46
SHS1Q07657 YOL085CYOL085C 342 nt17.42■□□□□ 0.38
SHS1Q07657 DBP2YNL112W 1641 nt17.21■□□□□ 0.35
SHS1Q07657 PKP1YIL042C 1185 nt17.11■□□□□ 0.33
SHS1Q07657 RPP1BYDL130W 321 nt17.05■□□□□ 0.32
SHS1Q07657 TRN1tP(UGG)A 72 nt17.03■□□□□ 0.32
SHS1Q07657 SUF9tP(UGG)F 72 nt17.03■□□□□ 0.32
SHS1Q07657 SUF8tP(UGG)H 72 nt17.03■□□□□ 0.32
SHS1Q07657 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt17.03■□□□□ 0.32
SHS1Q07657 SUF7tP(UGG)M 72 nt17.03■□□□□ 0.32
SHS1Q07657 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt17.03■□□□□ 0.32
SHS1Q07657 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt17.03■□□□□ 0.32
SHS1Q07657 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt17.03■□□□□ 0.32
SHS1Q07657 SUF11tP(UGG)O2 72 nt17.03■□□□□ 0.32
SHS1Q07657 CCC1YLR220W 969 nt16.8■□□□□ 0.28
SHS1Q07657 ATS1YAL020C 1002 nt16.48■□□□□ 0.23
SHS1Q07657 SCJ1YMR214W 1134 nt16.48■□□□□ 0.23
SHS1Q07657 YBR190WYBR190W 312 nt16.46■□□□□ 0.23
SHS1Q07657 PET122YER153C 765 nt16.27■□□□□ 0.2
SHS1Q07657 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt16.15■□□□□ 0.18
SHS1Q07657 RVS167YDR388W 1449 nt16.14■□□□□ 0.17
SHS1Q07657 SCR1SCR1 522 nt16.1■□□□□ 0.17
SHS1Q07657 RTC3YHR087W 336 nt16.04■□□□□ 0.16
SHS1Q07657 RRN5YLR141W 1092 nt15.81■□□□□ 0.12
SHS1Q07657 SHR5YOL110W 714 nt15.65■□□□□ 0.1
SHS1Q07657 YDJ1YNL064C 1230 nt15.64■□□□□ 0.09
SHS1Q07657 YER088W-BYER088W-B 147 nt15.51■□□□□ 0.07
SHS1Q07657 RSB1YOR049C 1065 nt15.5■□□□□ 0.07
SHS1Q07657 PST2YDR032C 597 nt15.26■□□□□ 0.03
SHS1Q07657 GAR1YHR089C 618 nt15.22■□□□□ 0.03
SHS1Q07657 DEP1YAL013W 1218 nt15.12■□□□□ 0.01
SHS1Q07657 URN1YPR152C 1398 nt15.11■□□□□ 0.01
SHS1Q07657 YNL208WYNL208W 600 nt14.93□□□□□ -0.02
SHS1Q07657 RPN10YHR200W 807 nt14.91□□□□□ -0.02
SHS1Q07657 OPI9YLR338W 858 nt14.88□□□□□ -0.03
SHS1Q07657 PUT4YOR348C 1884 nt14.84□□□□□ -0.03
SHS1Q07657 SAH1YER043C 1350 nt14.73□□□□□ -0.05
SHS1Q07657 TIR1YER011W 765 nt14.72□□□□□ -0.05
SHS1Q07657 YKL097CYKL097C 411 nt14.7□□□□□ -0.06
SHS1Q07657 ARE1YCR048W 1833 nt14.62□□□□□ -0.07
SHS1Q07657 SHU1YHL006C 453 nt14.59□□□□□ -0.07
SHS1Q07657 SSA1YAL005C 1929 nt14.53□□□□□ -0.08
SHS1Q07657 PUN1YLR414C 792 nt14.43□□□□□ -0.1
SHS1Q07657 YJR018WYJR018W 363 nt14.42□□□□□ -0.1
SHS1Q07657 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt14.41□□□□□ -0.1
SHS1Q07657 SRB2YHR041C 633 nt14.35□□□□□ -0.11
SHS1Q07657 POA1YBR022W 534 nt14.35□□□□□ -0.11
SHS1Q07657 YJR120WYJR120W 351 nt14.3□□□□□ -0.12
SHS1Q07657 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt14.29□□□□□ -0.12
SHS1Q07657 PTC2YER089C 1395 nt14.22□□□□□ -0.13
SHS1Q07657 RPP2BYDR382W 333 nt14.15□□□□□ -0.14
SHS1Q07657 YOR139CYOR139C 393 nt14.13□□□□□ -0.15
SHS1Q07657 WWM1YFL010C 636 nt14.1□□□□□ -0.15
SHS1Q07657 YGR021WYGR021W 873 nt14.07□□□□□ -0.16
SHS1Q07657 BUD23YCR047C 828 nt14.05□□□□□ -0.16
SHS1Q07657 HOM6YJR139C 1080 nt14.05□□□□□ -0.16
SHS1Q07657 BSC6YOL137W 1494 nt14.04□□□□□ -0.16
SHS1Q07657 NAB2YGL122C 1578 nt14.01□□□□□ -0.17
SHS1Q07657 MNP1YGL068W 585 nt13.99□□□□□ -0.17
SHS1Q07657 SSA3YBL075C 1950 nt13.98□□□□□ -0.17
SHS1Q07657 BDH2YAL061W 1254 nt13.93□□□□□ -0.18
SHS1Q07657 NPL3YDR432W 1245 nt13.92□□□□□ -0.18
SHS1Q07657 INM2YDR287W 879 nt13.89□□□□□ -0.19
SHS1Q07657 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt13.89□□□□□ -0.19
SHS1Q07657 FIS1YIL065C 468 nt13.88□□□□□ -0.19
SHS1Q07657 DAL1YIR027C 1383 nt13.87□□□□□ -0.19
SHS1Q07657 RKM5YLR137W 1104 nt13.83□□□□□ -0.2
SHS1Q07657 YOL037CYOL037C 354 nt13.82□□□□□ -0.2
SHS1Q07657 FPR4YLR449W 1179 nt13.79□□□□□ -0.2
SHS1Q07657 LSM3YLR438C-A 270 nt13.78□□□□□ -0.2
SHS1Q07657 YBL100CYBL100C 315 nt13.78□□□□□ -0.2
SHS1Q07657 PHO4YFR034C 939 nt13.75□□□□□ -0.21
SHS1Q07657 FUN26YAL022C 1554 nt13.63□□□□□ -0.23
SHS1Q07657 TRM9YML014W 840 nt13.61□□□□□ -0.23
SHS1Q07657 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt13.55□□□□□ -0.24
SHS1Q07657 IMT4tM(CAU)E 72 nt13.55□□□□□ -0.24
SHS1Q07657 IMT3tM(CAU)J3 72 nt13.55□□□□□ -0.24
SHS1Q07657 IMT1tM(CAU)O1 72 nt13.55□□□□□ -0.24
SHS1Q07657 IMT2tM(CAU)P 72 nt13.55□□□□□ -0.24
SHS1Q07657 CCT6YDR188W 1641 nt13.51□□□□□ -0.25
SHS1Q07657 YLR281CYLR281C 468 nt13.5□□□□□ -0.25
SHS1Q07657 YPS1YLR120C 1710 nt13.43□□□□□ -0.26
SHS1Q07657 WHI5YOR083W 888 nt13.42□□□□□ -0.26
SHS1Q07657 YDR095CYDR095C 411 nt13.39□□□□□ -0.27
SHS1Q07657 PUS2YGL063W 1113 nt13.38□□□□□ -0.27
SHS1Q07657 ALF1YNL148C 765 nt13.37□□□□□ -0.27
SHS1Q07657 SUF2tP(AGG)C 72 nt13.34□□□□□ -0.27
SHS1Q07657 SUF10tP(AGG)N 72 nt13.34□□□□□ -0.27
SHS1Q07657 SPT5YML010W 3192 nt13.3□□□□□ -0.28
SHS1Q07657 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt13.28□□□□□ -0.28
SHS1Q07657 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt13.24□□□□□ -0.29
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